More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0654 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  100 
 
 		 544 aa  1097    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  45.25 
 
 		 530 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  47.06 
 
 		 523 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  46.41 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  46.22 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  46.02 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  46.01 
 
 		 659 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  45.82 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  45.82 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  45.82 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  45.82 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  45.69 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  45.62 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  45.81 
 
 		 659 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  45.62 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  45.09 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  47.89 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  42.54 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  44.44 
 
 		 516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  45.4 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  41.63 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  43.17 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  43.17 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  43.17 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  43.17 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  43.17 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  43.17 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  46.45 
 
 		 533 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  45.28 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  42.57 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  40.33 
 
 		 508 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  44.42 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  42.44 
 
 		 657 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  39.55 
 
 		 600 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  41.57 
 
 		 532 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  43 
 
 		 525 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  40.53 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  42.04 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  40.08 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  40.08 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  42.34 
 
 		 685 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.29 
 
 		 550 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  39.06 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  42.58 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  38.65 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  40.59 
 
 		 548 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  40.88 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  40.59 
 
 		 548 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  40.42 
 
 		 531 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  42.62 
 
 		 682 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  38.27 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  38.65 
 
 		 676 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  38.49 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  38.65 
 
 		 676 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  38.65 
 
 		 673 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  40.28 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  41.51 
 
 		 682 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  39.77 
 
 		 577 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  42.74 
 
 		 545 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  39.77 
 
 		 660 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  38.57 
 
 		 606 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  40.25 
 
 		 667 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  41.54 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  43.23 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  42.21 
 
 		 660 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 583 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  42.32 
 
 		 662 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  38.83 
 
 		 551 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  37.82 
 
 		 574 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  37.9 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  37.68 
 
 		 676 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  41.5 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  42.42 
 
 		 668 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  38.61 
 
 		 687 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  37.64 
 
 		 592 aa  359  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  37.59 
 
 		 610 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  40.66 
 
 		 661 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  41.07 
 
 		 661 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  39.62 
 
 		 698 aa  356  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  39.35 
 
 		 646 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  39.27 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  37.95 
 
 		 671 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  41.35 
 
 		 676 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  40.33 
 
 		 526 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  41.19 
 
 		 658 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  41.06 
 
 		 661 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  40.9 
 
 		 664 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  39.92 
 
 		 582 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  37.52 
 
 		 656 aa  351  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  39.92 
 
 		 582 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  36.15 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  40.9 
 
 		 673 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  39.92 
 
 		 582 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  38.76 
 
 		 653 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  38.92 
 
 		 682 aa  348  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  40.04 
 
 		 661 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  36.53 
 
 		 681 aa  347  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  38.31 
 
 		 676 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  38.31 
 
 		 676 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  38.31 
 
 		 676 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>