More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0641 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  100 
 
 
249 aa  500  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  60.74 
 
 
254 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
252 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 
256 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  51.03 
 
 
256 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  51.03 
 
 
256 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  51.03 
 
 
256 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  52.44 
 
 
254 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  49.19 
 
 
257 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  50.41 
 
 
256 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  50.41 
 
 
256 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  50.41 
 
 
256 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  48.37 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 
251 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
254 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
255 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.07 
 
 
235 aa  198  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
267 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
246 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
259 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.75 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  43.9 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
241 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
255 aa  168  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
256 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.94 
 
 
253 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
246 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  44.14 
 
 
252 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
265 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
248 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  41.7 
 
 
291 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.82 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
260 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
257 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 
252 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
286 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.69 
 
 
250 aa  161  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
260 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.66 
 
 
245 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
246 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
251 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
263 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
246 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
255 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 
248 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
258 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
259 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
251 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
246 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
246 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
255 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
254 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
246 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
267 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.53 
 
 
246 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
254 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
260 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
265 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 
245 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.78 
 
 
246 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.86 
 
 
246 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
274 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
252 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
260 aa  158  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>