More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0604 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  100 
 
 
71 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  66.67 
 
 
71 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  68.66 
 
 
73 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  68.66 
 
 
72 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  61.43 
 
 
70 aa  97.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  67.16 
 
 
72 aa  98.2  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  67.19 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  58.57 
 
 
70 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  67.16 
 
 
72 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  61.76 
 
 
73 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
71 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
71 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
71 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 
71 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  61.19 
 
 
68 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  94.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  57.14 
 
 
70 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
71 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  54.29 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  60.61 
 
 
71 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
70 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  54.29 
 
 
70 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
71 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  91.3  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4037  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
70 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
70 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
70 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
70 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
70 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
71 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
70 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
70 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  54.29 
 
 
70 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  52.86 
 
 
70 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  52.86 
 
 
70 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  52.86 
 
 
70 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  52.86 
 
 
70 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  60.94 
 
 
71 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  53.73 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  53.73 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  61.43 
 
 
70 aa  89.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  64.29 
 
 
70 aa  89.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  56.92 
 
 
68 aa  88.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 
74 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  60 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  50.7 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
66 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  60 
 
 
71 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  56.92 
 
 
66 aa  87  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  56.06 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  54.41 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  56.72 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  61.43 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  56.06 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  62.12 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  52.86 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  58.46 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
71 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  63.24 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
71 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  63.64 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  50.75 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
71 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  56.92 
 
 
73 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
75 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
75 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  62.12 
 
 
72 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  50.75 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
73 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  59.09 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
68 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  56.72 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
72 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>