More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0549 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
341 aa  689    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  54.83 
 
 
349 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  49.84 
 
 
350 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  49.84 
 
 
350 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  49.52 
 
 
365 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  49.52 
 
 
365 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  51.91 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  53.55 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  45.51 
 
 
355 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  55.38 
 
 
345 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  50.79 
 
 
336 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  52.81 
 
 
353 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  49.53 
 
 
353 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  52.68 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  49.7 
 
 
339 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  48.64 
 
 
337 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  47.48 
 
 
366 aa  331  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  47.83 
 
 
342 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  47.01 
 
 
347 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  46.71 
 
 
348 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  46.49 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  48.9 
 
 
355 aa  318  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  49.07 
 
 
337 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 
347 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  45.3 
 
 
351 aa  312  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 
352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  44.15 
 
 
348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  42.06 
 
 
346 aa  302  5.000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  46.27 
 
 
347 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  45.45 
 
 
347 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 
352 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  44.38 
 
 
351 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.69 
 
 
335 aa  296  5e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.41 
 
 
334 aa  294  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  41.02 
 
 
351 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  43.63 
 
 
337 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  43.31 
 
 
335 aa  289  4e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  42.09 
 
 
347 aa  287  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  40.82 
 
 
337 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.93 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  45.03 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  44.3 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  42.39 
 
 
336 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.19 
 
 
334 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  43.96 
 
 
349 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.3 
 
 
336 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.51 
 
 
334 aa  279  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  41.57 
 
 
338 aa  278  9e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  43.96 
 
 
347 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  41.61 
 
 
374 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 
346 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.88 
 
 
334 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  43.67 
 
 
339 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 
347 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  41.01 
 
 
341 aa  273  3e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  41.76 
 
 
335 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 
372 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 
337 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  39.94 
 
 
349 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  39.31 
 
 
334 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 
338 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  42.81 
 
 
335 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 
338 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 
335 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  43.45 
 
 
335 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  41.14 
 
 
333 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 
335 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  38.92 
 
 
339 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 
338 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 
335 aa  261  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 
335 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  40.99 
 
 
336 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 
335 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  36.23 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  39.47 
 
 
380 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 
333 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  39.63 
 
 
333 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  39.63 
 
 
333 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  39.17 
 
 
338 aa  252  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  35.69 
 
 
336 aa  252  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.68 
 
 
334 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  37.62 
 
 
332 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 
335 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  39.01 
 
 
333 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  36.23 
 
 
337 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  39.24 
 
 
332 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  37.01 
 
 
342 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  37.09 
 
 
342 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  40.58 
 
 
335 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.46 
 
 
352 aa  249  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  40.99 
 
 
345 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 
335 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  37.9 
 
 
350 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  41.23 
 
 
345 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 
335 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  39.56 
 
 
332 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  39.81 
 
 
326 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 
347 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>