90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0542 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  100 
 
 
314 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  56.25 
 
 
311 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  53.59 
 
 
332 aa  326  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  51.76 
 
 
302 aa  301  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  57.59 
 
 
302 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  50.17 
 
 
300 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.3 
 
 
302 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  51.06 
 
 
296 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  47.08 
 
 
306 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  49.3 
 
 
315 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  51.58 
 
 
298 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  51.23 
 
 
306 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  47.28 
 
 
304 aa  276  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  50 
 
 
306 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  45.33 
 
 
304 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  46.71 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  46.13 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  45.64 
 
 
303 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  45.77 
 
 
299 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  45.77 
 
 
299 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.1 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.43 
 
 
268 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  35.04 
 
 
266 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.72 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.92 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.21 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.55 
 
 
264 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.48 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.27 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.64 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  25 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.99 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.02 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.24 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 
259 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.4 
 
 
279 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 
274 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.4 
 
 
285 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.6 
 
 
257 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.63 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.91 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  25.7 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  25.7 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  25.7 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.73 
 
 
260 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  24.68 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  25.7 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 
270 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.7 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25.7 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.6 
 
 
257 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.81 
 
 
275 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.6 
 
 
257 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.2 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.39 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.6 
 
 
257 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  23.75 
 
 
281 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.07 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.39 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.29 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.19 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.97 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  24.19 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.91 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  26.51 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.29 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.21 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  23.53 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  21.6 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.85 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.86 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.86 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  26.86 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  26.86 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.63 
 
 
239 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  25.61 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  25.61 
 
 
354 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  26.22 
 
 
352 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  26.22 
 
 
308 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  26.22 
 
 
308 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>