61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0464 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  307  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  47.79 
 
 
140 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  46.72 
 
 
140 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  45.99 
 
 
140 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  39.42 
 
 
140 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  46.72 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  46.04 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  38.06 
 
 
153 aa  123  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 
142 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  37.14 
 
 
167 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  45.26 
 
 
140 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  45.26 
 
 
140 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  38.64 
 
 
141 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  43.88 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  36.96 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  36.96 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  36.3 
 
 
139 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  39.42 
 
 
167 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  37.68 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  37.04 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  37.14 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  35.71 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  35.82 
 
 
143 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  36.96 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  37.23 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  35 
 
 
148 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  35 
 
 
148 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  35 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  36.64 
 
 
148 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  36.76 
 
 
156 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  34.29 
 
 
148 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  39.68 
 
 
149 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  36.57 
 
 
159 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  30.77 
 
 
147 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  27.78 
 
 
146 aa  87  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  32.33 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  35.46 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  32.85 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  28.79 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  26.87 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  25.66 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  26.67 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  27.19 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  27.42 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  27.34 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  25.81 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  25.81 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  28.95 
 
 
147 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  25.86 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  25.86 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  23.39 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  22.3 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  21.93 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  26.17 
 
 
132 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  25.86 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  28.24 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>