More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0453 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.29 
 
 
301 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.29 
 
 
301 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.29 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  43.77 
 
 
296 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.21 
 
 
302 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  42.5 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.21 
 
 
293 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.52 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  39.79 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.56 
 
 
295 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.48 
 
 
285 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.99 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  32.18 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36 
 
 
569 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.78 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  38.73 
 
 
291 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  39.58 
 
 
308 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  31.83 
 
 
288 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0014  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.14 
 
 
294 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.06 
 
 
293 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0015  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.22 
 
 
294 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 
546 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  34.25 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.55 
 
 
291 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  33.67 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0016  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.22 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.726882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3700  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  36.26 
 
 
289 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  38.32 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  32.88 
 
 
300 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  33.68 
 
 
303 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  37.82 
 
 
294 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  32.07 
 
 
300 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  33.56 
 
 
300 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.84 
 
 
300 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.68 
 
 
289 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.35 
 
 
309 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  34.53 
 
 
291 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.89 
 
 
300 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  34.75 
 
 
297 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.71 
 
 
293 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  39.51 
 
 
315 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.45 
 
 
574 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  34.25 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  35.66 
 
 
293 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.01 
 
 
293 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.4 
 
 
280 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  36.01 
 
 
298 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  36.52 
 
 
295 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.52 
 
 
289 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.14 
 
 
318 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.86 
 
 
309 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  37.06 
 
 
291 aa  148  9e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  36.17 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.16 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.16 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  32.9 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.33 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.1 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.69 
 
 
299 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  35 
 
 
292 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.95 
 
 
292 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  35.14 
 
 
288 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.64 
 
 
289 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  35.66 
 
 
303 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  36.69 
 
 
291 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.84 
 
 
290 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.63 
 
 
289 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  35.96 
 
 
296 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  35.96 
 
 
309 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2591  gluconolactonase  35.02 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000189317  normal  0.0284024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.01 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.07 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.87 
 
 
304 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.87 
 
 
286 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.5 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  32.39 
 
 
290 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  34.53 
 
 
280 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
315 aa  135  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.56 
 
 
288 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3138  gluconolactonase  33.21 
 
 
279 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.97 
 
 
304 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3876  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.21 
 
 
279 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  33.45 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.43 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  34.3 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  35.38 
 
 
281 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0125  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.18 
 
 
286 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2356  senescence marker protein-30 family protein  37.55 
 
 
311 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.62 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5696  calcium-binding protein  36.4 
 
 
249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086452  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1058  senescence marker protein-30 family protein  36.1 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  34.14 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1143  gluconolactonase  36.1 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.52 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5842  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.47 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.11 
 
 
311 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0479  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.99 
 
 
312 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1810  senescence marker protein-30 family protein  35.87 
 
 
311 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0845  senescence marker protein-30 family protein  35.87 
 
 
311 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>