More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0424 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0424  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
275 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0891588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  83.88 
 
 
273 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  83.88 
 
 
273 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06280  50S ribosomal protein L2  85.35 
 
 
273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0722  50S ribosomal protein L2  81.45 
 
 
275 aa  447  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000807709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  77.82 
 
 
274 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  77.82 
 
 
274 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4273  50S ribosomal protein L2  81.62 
 
 
274 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288433  unclonable  0.00000000000501812 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  77.82 
 
 
274 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
273 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
273 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3906  50S ribosomal protein L2  84.31 
 
 
274 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  77.45 
 
 
274 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0161  50S ribosomal protein L2  79.27 
 
 
275 aa  434  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128131  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  77.57 
 
 
273 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4545  50S ribosomal protein L2  83.94 
 
 
274 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0677044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5076  50S ribosomal protein L2  84.31 
 
 
274 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000626966  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  77.57 
 
 
273 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0323  50S ribosomal protein L2  80.88 
 
 
274 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0963  50S ribosomal protein L2  81.82 
 
 
275 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00625904  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  77.57 
 
 
273 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  77.57 
 
 
273 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  77.57 
 
 
273 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
273 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  77.57 
 
 
273 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4746  50S ribosomal protein L2  83.21 
 
 
274 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00153291  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0629  ribosomal protein L2  83.21 
 
 
274 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000177607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  75.64 
 
 
274 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00448  50S ribosomal protein L2  79.41 
 
 
274 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4687  50S ribosomal protein L2  78.18 
 
 
275 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000499794  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  77.21 
 
 
273 aa  431  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0457  50S ribosomal protein L2  82.85 
 
 
274 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.271317  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4167  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0199  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000102621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0203  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000173146  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00733  50S ribosomal protein L2  80.51 
 
 
274 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3756  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0282  50S ribosomal protein L2  74.82 
 
 
277 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161647  hitchhiker  0.00000193986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4053  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000480154  unclonable  0.0000000000078999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0187  50S ribosomal protein L2  78.55 
 
 
275 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000586995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0490  50S ribosomal protein L2  82.85 
 
 
274 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000253797  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0151  50S ribosomal protein L2  79.41 
 
 
274 aa  427  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0487  50S ribosomal protein L2  82.48 
 
 
274 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0341387  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0870  50S ribosomal protein L2  78.68 
 
 
274 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0234  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
274 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0173  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
274 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2171  50S ribosomal protein L2  79.41 
 
 
274 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000003452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0472  50S ribosomal protein L2  77.94 
 
 
274 aa  424  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000311263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0202  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000118322  unclonable  0.0000000000286265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0197  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0317166  decreased coverage  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0202  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000998768  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0216  50S ribosomal protein L2  78.31 
 
 
274 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000116204  unclonable  0.00000865154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4314  50S ribosomal protein L2  77.82 
 
 
275 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100463  unclonable  0.0000000000749477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0408  50S ribosomal protein L2  74.18 
 
 
275 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000019918  normal  0.14889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0770  50S ribosomal protein L2  73.16 
 
 
277 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  73.9 
 
 
275 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3521  50S ribosomal protein L2  76.73 
 
 
275 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000287143  hitchhiker  0.00000119311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  72.43 
 
 
275 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001739  LSU ribosomal protein L2p (L8e)  79.04 
 
 
274 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  72.43 
 
 
275 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  73.16 
 
 
275 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3335  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  72.43 
 
 
275 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  78.75 
 
 
274 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  72.43 
 
 
275 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  72.43 
 
 
275 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  72.43 
 
 
275 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2166  ribosomal protein L2  73.26 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000491264  normal  0.227842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0298  50S ribosomal protein L2  77.29 
 
 
275 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00025292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3016  50S ribosomal protein L2  72.53 
 
 
276 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000236322  decreased coverage  0.00250234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2947  50S ribosomal protein L2  72.16 
 
 
276 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0126826  decreased coverage  0.00000017325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3294  50S ribosomal protein L2  72.53 
 
 
276 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000105073  hitchhiker  0.00000920299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2629  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000217343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3773  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000105761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0252  50S ribosomal protein L2  73.16 
 
 
275 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3166  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000940413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3801  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0211596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3743  50S ribosomal protein L2  73.53 
 
 
275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000272978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3065  50S ribosomal protein L2  72.79 
 
 
275 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000040785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3481  50S ribosomal protein L2  73.16 
 
 
275 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000122656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0855  50S ribosomal protein L2  76.56 
 
 
274 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.584822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0326  ribosomal protein L2  75.74 
 
 
274 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000480771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1927  50S ribosomal protein L2  73.16 
 
 
275 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000132135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2369  50S ribosomal protein L2  72.73 
 
 
275 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.962452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0436  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 
275 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110098  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 
275 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000398645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3176  50S ribosomal protein L2  70.7 
 
 
276 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3314  50S ribosomal protein L2  71.06 
 
 
276 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000017691  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  72.43 
 
 
272 aa  394  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>