228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0407 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  37.05 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  36.65 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  36.65 
 
 
249 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  35.83 
 
 
248 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  35.94 
 
 
249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  36 
 
 
249 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  37.11 
 
 
248 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  35.41 
 
 
249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  35.41 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  36.82 
 
 
251 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  35.29 
 
 
249 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  33.33 
 
 
242 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  30.8 
 
 
266 aa  95.9  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  34.67 
 
 
248 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  29.6 
 
 
242 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  31.02 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  30 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  31.08 
 
 
262 aa  85.9  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.06 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  34.15 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  35.85 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  36.36 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  35.71 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  29.81 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.11 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  29.3 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  29.3 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  29.3 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  29.3 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  29.3 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  30.71 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  35.93 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.91 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  26.17 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.73 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  27.52 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.28 
 
 
263 aa  77  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  31.56 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  32.18 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  24.34 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  25.3 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.94 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  28.68 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.7 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  29.03 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  31.68 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  28.63 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  29.2 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  27.76 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  28.85 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.29 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  30.2 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  27.68 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  29.6 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  29.8 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  29.65 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  28.74 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  28.46 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  29.03 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  29.03 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  34.25 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.67 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  28.4 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  28.4 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  26.37 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  26.82 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  29.48 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  31.74 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  29.17 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  24.8 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  27.92 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  26.51 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  29.41 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  27.27 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  25.21 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  28.83 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  27.02 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.43 
 
 
261 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  28.83 
 
 
221 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.92 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.38 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  27.38 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  25.87 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  25.93 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.27 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  27.86 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  27.78 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.11 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  29.72 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  29.7 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  33.33 
 
 
210 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 
254 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.41 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  29.41 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  25.94 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  26.05 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  32.68 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  26.34 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  27.42 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>