More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0403 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
261 aa  518  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  56.75 
 
 
258 aa  281  6e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  52.76 
 
 
255 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  3.78938e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
255 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  56.67 
 
 
258 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  53.15 
 
 
255 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  52.76 
 
 
255 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  52.76 
 
 
255 aa  258  5e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  52.57 
 
 
257 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  54.77 
 
 
257 aa  254  1e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  54.36 
 
 
257 aa  254  1e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  53.47 
 
 
261 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  54.22 
 
 
256 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  49.81 
 
 
256 aa  241  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  50.42 
 
 
255 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  48.43 
 
 
254 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  48.96 
 
 
255 aa  228  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  47.79 
 
 
249 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  47.47 
 
 
256 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.50379e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  49.79 
 
 
254 aa  221  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.5438e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  46.37 
 
 
263 aa  221  1e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  49.37 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  49.37 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  47.83 
 
 
250 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  49.37 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  49.37 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  49.37 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  50.41 
 
 
254 aa  218  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  47.62 
 
 
250 aa  218  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  50 
 
 
254 aa  218  8e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  50.41 
 
 
254 aa  218  9e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  48.54 
 
 
254 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  50 
 
 
254 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
255 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  46.83 
 
 
250 aa  216  3e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  47.45 
 
 
250 aa  215  6e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  49.18 
 
 
254 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  49.18 
 
 
278 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  49.18 
 
 
254 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  213  2e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  47.22 
 
 
250 aa  213  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  213  2e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2948e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  213  2e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  46.25 
 
 
250 aa  213  3e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  213  3e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  212  4e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  45.63 
 
 
250 aa  212  4e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  212  4e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  212  4e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  46.43 
 
 
250 aa  212  4e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  46.03 
 
 
250 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  45.38 
 
 
251 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
270 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  44.98 
 
 
255 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  42.06 
 
 
270 aa  200  2e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  5.482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  43.95 
 
 
248 aa  200  2e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  42.39 
 
 
270 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
255 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  45.78 
 
 
251 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  41.34 
 
 
255 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  41.56 
 
 
255 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
255 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  44.4 
 
 
252 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  41.56 
 
 
255 aa  182  4e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
288 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  41.7 
 
 
258 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
255 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  43.36 
 
 
254 aa  175  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.49 
 
 
258 aa  174  1e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  39.68 
 
 
285 aa  174  1e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  40.49 
 
 
258 aa  174  1e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.49 
 
 
258 aa  174  1e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  40.49 
 
 
258 aa  174  1e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  42.11 
 
 
257 aa  174  1e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.49 
 
 
258 aa  174  1e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  40.49 
 
 
258 aa  174  1e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.49 
 
 
258 aa  174  1e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.89 
 
 
258 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  41.3 
 
 
258 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.89 
 
 
258 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.89 
 
 
258 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.24 
 
 
258 aa  173  3e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.08 
 
 
258 aa  173  3e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  42.62 
 
 
257 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.21 
 
 
259 aa  165  6e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  40.16 
 
 
257 aa  165  7e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  40.69 
 
 
253 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.16 
 
 
259 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.21 
 
 
263 aa  164  1e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  40.52 
 
 
248 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  39.09 
 
 
237 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  39.09 
 
 
237 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>