263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0357 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  100 
 
 
166 aa  330  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  63.45 
 
 
148 aa  195  2e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  61.04 
 
 
157 aa  191  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  64.63 
 
 
153 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  63.19 
 
 
149 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  63.45 
 
 
157 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  63.51 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  63.51 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  63.51 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  63.51 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  63.51 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  63.51 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  63.51 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  58.5 
 
 
159 aa  173  1e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  54.79 
 
 
151 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  54.79 
 
 
151 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  54.79 
 
 
151 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  52.35 
 
 
152 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.72 
 
 
149 aa  167  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  55.17 
 
 
152 aa  163  1e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  54.97 
 
 
149 aa  162  2e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  54.29 
 
 
153 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  54.48 
 
 
152 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  53.79 
 
 
152 aa  157  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  49.01 
 
 
158 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  54.11 
 
 
181 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.47 
 
 
149 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  8.11694e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  44.22 
 
 
148 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  47.26 
 
 
149 aa  146  1e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  47.26 
 
 
149 aa  146  1e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.34 
 
 
149 aa  145  2e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.45 
 
 
152 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.95 
 
 
148 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  43.33 
 
 
150 aa  142  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  48.28 
 
 
322 aa  141  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  45.21 
 
 
149 aa  139  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  42.18 
 
 
148 aa  139  2e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  47.65 
 
 
152 aa  138  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.95 
 
 
152 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  44.52 
 
 
148 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
148 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
370 aa  136  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1828  ribose-5-phosphate isomerase  47.1 
 
 
162 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.64 
 
 
154 aa  136  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  44.97 
 
 
149 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.53 
 
 
149 aa  134  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.29497e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  48.09 
 
 
149 aa  132  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.41182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.52 
 
 
147 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.80792e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  52.63 
 
 
145 aa  131  4e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  42.57 
 
 
148 aa  130  7e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  44.19 
 
 
148 aa  130  1e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.22 
 
 
153 aa  129  2e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  44.44 
 
 
162 aa  129  2e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
148 aa  129  2e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.14 
 
 
148 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  47.14 
 
 
145 aa  128  4e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  46.09 
 
 
149 aa  128  4e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  44.52 
 
 
158 aa  127  5e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.86 
 
 
143 aa  126  1e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  44.67 
 
 
149 aa  126  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.71 
 
 
142 aa  126  1e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.15199e-06  hitchhiker  1.8847e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.86 
 
 
146 aa  125  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  50.39 
 
 
148 aa  126  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
153 aa  124  4e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0352  ribose 5-phosphate isomerase B  43.54 
 
 
150 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.54 
 
 
149 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.86604e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
147 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  9.08103e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  43.95 
 
 
159 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
147 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
147 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.46279e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  43.95 
 
 
159 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
147 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.05511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  43.95 
 
 
159 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
147 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.04947e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
147 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.49757e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  49.66 
 
 
147 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 
156 aa  121  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  41.67 
 
 
149 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  41.67 
 
 
149 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  39.74 
 
 
152 aa  120  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  39.74 
 
 
152 aa  120  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  41.67 
 
 
149 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  41.67 
 
 
149 aa  120  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.94 
 
 
163 aa  120  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  44.44 
 
 
146 aa  120  1e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.1 
 
 
149 aa  120  1e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.52 
 
 
149 aa  119  1e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.05549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  42.86 
 
 
148 aa  119  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
147 aa  120  1e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  unclonable  3.67009e-26 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.83 
 
 
147 aa  120  1e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  45.83 
 
 
147 aa  119  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  45 
 
 
143 aa  119  2e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
147 aa  119  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  9.1391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
147 aa  119  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.11048e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  45 
 
 
143 aa  119  2e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  39.29 
 
 
150 aa  119  2e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.26 
 
 
150 aa  119  2e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.57 
 
 
144 aa  119  2e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  8.76493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  45.83 
 
 
147 aa  119  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>