69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0287 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  793    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  31.62 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  31 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  31.18 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  31.71 
 
 		 380 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  30.91 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  30.91 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  30.83 
 
 		 408 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  30.03 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  30.71 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  30.73 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  30.73 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  30.73 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  28.65 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  27.2 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  29.92 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  29.16 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  30.89 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  28.37 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  30.25 
 
 		 346 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  28.85 
 
 		 477 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  28.3 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.01 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  28.91 
 
 		 388 aa  99.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  27.7 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  26.81 
 
 		 475 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  25.31 
 
 		 475 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  28.21 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  26.07 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  27.7 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  26.23 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  26.5 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  26.67 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  27.93 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  27.33 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  23.78 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  26.39 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  26.61 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  25.22 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  31.33 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  25.63 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  24.39 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  24.39 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  22.54 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  24.22 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  23.78 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  25.49 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  25.29 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  24.5 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  26.69 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  23.36 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  24.72 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  26.62 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  23.56 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  24.64 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  24.14 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  25.56 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0258  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  24.28 
 
 		 371 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  25.14 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  23.12 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  24.35 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  22.85 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  25.32 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  32.45 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  29.77 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  30.95 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  32.03 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>