More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0259 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
324 aa  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0761  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  74 
 
 
320 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0629996  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.52 
 
 
320 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  62.34 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  62.34 
 
 
325 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.58 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0888  sugar ABC transporter, permease protein  74 
 
 
320 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67 
 
 
303 aa  397  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.236219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.12 
 
 
328 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.56 
 
 
320 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.41 
 
 
320 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.37 
 
 
304 aa  341  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.95 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
312 aa  288  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.59 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 
297 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
293 aa  255  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
293 aa  255  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
295 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.16 
 
 
293 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000240561  normal  0.90976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
307 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
296 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
310 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
306 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
299 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
435 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
309 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
427 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
345 aa  192  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.65014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
304 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 
338 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0789775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
301 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
315 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
355 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
294 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288658  normal  0.0756683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
312 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  36.97 
 
 
292 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
357 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
294 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
319 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.610005  normal  0.71076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
317 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
294 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
294 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
294 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6238  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  33.33 
 
 
294 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
320 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
308 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
308 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.853442  normal  0.685254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
308 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
308 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
312 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  30.25 
 
 
315 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
292 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
299 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
293 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
345 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
291 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
307 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
318 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
310 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
323 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11261  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugA  36.07 
 
 
307 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
310 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
313 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
313 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
262 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
309 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
310 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  30.96 
 
 
318 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
311 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
291 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
307 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  32.9 
 
 
312 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
311 aa  159  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
295 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
304 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
309 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.54 
 
 
321 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  34.08 
 
 
323 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
303 aa  155  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
314 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.95 
 
 
318 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
311 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
329 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.339451  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
294 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
305 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
305 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
290 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0463372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>