214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0235 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  53.45 
 
 
598 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  54.05 
 
 
624 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  55.31 
 
 
592 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  56.81 
 
 
618 aa  673    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
599 aa  1237    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  55.25 
 
 
620 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  58.11 
 
 
598 aa  733    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  54.97 
 
 
593 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  55.65 
 
 
595 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  53.27 
 
 
606 aa  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  58.01 
 
 
596 aa  718    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  57.81 
 
 
603 aa  718    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  56.57 
 
 
593 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  55.93 
 
 
657 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  56.44 
 
 
606 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  53.1 
 
 
606 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  57.07 
 
 
595 aa  696    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  56.64 
 
 
598 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  56.01 
 
 
640 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  52.63 
 
 
594 aa  621  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  52.28 
 
 
597 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  50.85 
 
 
589 aa  620  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  51.6 
 
 
597 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  51.6 
 
 
598 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  38.14 
 
 
593 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  35.91 
 
 
594 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  36.27 
 
 
593 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  38.27 
 
 
596 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  35.82 
 
 
623 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  36.92 
 
 
586 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  37 
 
 
602 aa  333  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  35.97 
 
 
623 aa  333  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  36.29 
 
 
600 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.95 
 
 
602 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  36.48 
 
 
619 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  36.73 
 
 
602 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  33.66 
 
 
613 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  35.82 
 
 
605 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  35.5 
 
 
625 aa  326  8.000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  35.19 
 
 
609 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  36.75 
 
 
594 aa  323  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  35.74 
 
 
609 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  35.41 
 
 
609 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  35.22 
 
 
611 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  34.53 
 
 
609 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  34.53 
 
 
609 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  34.37 
 
 
609 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  35.3 
 
 
629 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.56 
 
 
597 aa  316  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  35.2 
 
 
602 aa  316  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  33.83 
 
 
598 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  35.33 
 
 
617 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  34.72 
 
 
600 aa  312  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.95 
 
 
601 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  34.49 
 
 
605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.38 
 
 
613 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  35.62 
 
 
594 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  33.88 
 
 
601 aa  309  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 
610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  36.04 
 
 
628 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 
599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  34.06 
 
 
627 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  34 
 
 
605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  33.44 
 
 
612 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  34.39 
 
 
594 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  34.22 
 
 
613 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  35.22 
 
 
598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 
608 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  32.66 
 
 
619 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 
598 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  32.5 
 
 
619 aa  301  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  33.77 
 
 
850 aa  300  6e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  33.28 
 
 
665 aa  300  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 
620 aa  299  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 
600 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  35.44 
 
 
596 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  35.34 
 
 
611 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  34.17 
 
 
599 aa  297  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 
593 aa  297  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  34.17 
 
 
602 aa  296  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  33.12 
 
 
614 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  33.61 
 
 
602 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  34.31 
 
 
616 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  33.78 
 
 
599 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.23 
 
 
610 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  32.74 
 
 
595 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  32.27 
 
 
619 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  33.67 
 
 
629 aa  293  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  32.9 
 
 
598 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  33.33 
 
 
626 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  31.74 
 
 
606 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  30.57 
 
 
656 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  32.9 
 
 
626 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  31.77 
 
 
601 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>