178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0213 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  100 
 
 
315 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  70.7 
 
 
314 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  66.03 
 
 
319 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  66.03 
 
 
319 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  65.71 
 
 
319 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  63.07 
 
 
314 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  62.42 
 
 
314 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  44.52 
 
 
312 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  45.87 
 
 
313 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  44.19 
 
 
312 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  41.72 
 
 
322 aa  258  7e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  45.36 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  40.95 
 
 
318 aa  245  6e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  32.34 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  39.68 
 
 
324 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  32.42 
 
 
393 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  32.88 
 
 
439 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  38.19 
 
 
337 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  38.14 
 
 
337 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  37.37 
 
 
366 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  37.37 
 
 
337 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  37.37 
 
 
337 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  35.84 
 
 
329 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  35.86 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  36.55 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  32.92 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  36.27 
 
 
350 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  34.68 
 
 
303 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  32.77 
 
 
328 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 
330 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  33.6 
 
 
347 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  31.76 
 
 
291 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  32.77 
 
 
329 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  37.44 
 
 
484 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  35.74 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  30.43 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  34.78 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  36.62 
 
 
305 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  34.52 
 
 
329 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  29.58 
 
 
285 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  32.18 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  29 
 
 
459 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  34.77 
 
 
339 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  40 
 
 
313 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  29.58 
 
 
285 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  34.27 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  39.53 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  33.79 
 
 
318 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  34.31 
 
 
301 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  34.59 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  34.97 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  34.9 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.97 
 
 
359 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  29.39 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  29.39 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  29.39 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 
358 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  33.09 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.6 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.6 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  29.11 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  34.68 
 
 
321 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  29.05 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  31 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  36.55 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  28.81 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.77 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  29.69 
 
 
304 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  34.68 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  34.3 
 
 
345 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  34.78 
 
 
315 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  30.43 
 
 
360 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  35.11 
 
 
438 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  35.11 
 
 
438 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  35.11 
 
 
379 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  38.17 
 
 
320 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  28.91 
 
 
410 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  29.52 
 
 
401 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  31.82 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  29.89 
 
 
416 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  36.63 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  34.54 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  30.61 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  36.4 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  28.71 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  36.22 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  30.29 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  29.22 
 
 
409 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  29.49 
 
 
409 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  33.81 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  33.81 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  33.81 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  32.88 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  30.08 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  32.95 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  27.99 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  32.59 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30.33 
 
 
298 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>