128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0093 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  819    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  54.9 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  54.39 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  54.52 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  49.87 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  50 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  49.74 
 
 		 426 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  49.74 
 
 		 426 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  50 
 
 		 426 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  50.26 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  50.26 
 
 		 426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  48.33 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  48.33 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  49.1 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  48.99 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  49.49 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  49.49 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  49.49 
 
 		 425 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  48.47 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  48.72 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  47.81 
 
 		 422 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  48.72 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  48.47 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  47.96 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  47.96 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  47.96 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  47.96 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  44.95 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4770  hypothetical protein  46.41 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  42.49 
 
 		 406 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  39.66 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  40.71 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  38.58 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  39.86 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  40.38 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  39.76 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0577  alanine racemase domain protein  39.1 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  35.77 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  38.61 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  40.66 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  37.96 
 
 		 369 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  38.74 
 
 		 409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  38.42 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  35.86 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06355  D-serine deaminase  42.7 
 
 		 259 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  35.8 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  35.71 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  35.56 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  35.56 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08300  predicted amino acid aldolase or racemase  37.32 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.711035  normal  0.0558619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  35.4 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  35.57 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  34.43 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  35.38 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  32.9 
 
 		 379 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  34.21 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2983  D-amino acid deaminase  35.41 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.644238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06354  D-serine deaminase  51.2 
 
 		 148 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6379  hypothetical protein  30.66 
 
 		 436 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.619709  normal  0.462883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.01 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  28.61 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  21.87 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  25.08 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.14 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  26.74 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  27.15 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  27.73 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  27.73 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  25.51 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  25.4 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  25.5 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  30.04 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  22.22 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  25.4 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  32.5 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.2 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  26.67 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  23.69 
 
 		 368 aa  67  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  28.57 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  26.79 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  23.85 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  25.64 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  23.73 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  24.12 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.58 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.32 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.23 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.75 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  25.33 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.79 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  25.56 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.47 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  28.51 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  28.51 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  28.24 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  24.72 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.61 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  22.49 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>