More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0089 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  64.41 
 
 		 506 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  100 
 
 		 496 aa  978    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  62.32 
 
 		 489 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 483 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  29.96 
 
 		 460 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27 
 
 		 484 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.51 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.02 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  28.23 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.74 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  29.98 
 
 		 479 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  26.89 
 
 		 459 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.56 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.5 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.65 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.86 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.53 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.16 
 
 		 493 aa  103  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.55 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  29.21 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.29 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.29 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.83 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.01 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.88 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.41 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.88 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.88 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.38 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.38 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.38 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  26.06 
 
 		 496 aa  97.4  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  26.04 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  28.61 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.63 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.18 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  22.85 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.67 
 
 		 474 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.25 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.83 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.68 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.19 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  25.35 
 
 		 487 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.91 
 
 		 492 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 638 aa  94  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  25.81 
 
 		 489 aa  94  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  23.57 
 
 		 479 aa  93.6  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.91 
 
 		 492 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  22.06 
 
 		 478 aa  93.2  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.25 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.51 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.29 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  25.53 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.61 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.9 
 
 		 526 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.6 
 
 		 520 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.51 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 493 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 493 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  25.62 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 499 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.51 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.51 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  25.24 
 
 		 499 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  26.21 
 
 		 494 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  26.21 
 
 		 494 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  26.21 
 
 		 494 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  24.83 
 
 		 492 aa  91.3  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.44 
 
 		 522 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.31 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  25.69 
 
 		 506 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  24.95 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.94 
 
 		 484 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.31 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.71 
 
 		 492 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  23.17 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.85 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  27.33 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  25.97 
 
 		 503 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.14 
 
 		 539 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>