104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0081 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  497  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  60.62 
 
 
273 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  37.97 
 
 
274 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  39.32 
 
 
277 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  38.3 
 
 
265 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  38.89 
 
 
277 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  38.89 
 
 
277 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  38.53 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  33.08 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  33.85 
 
 
678 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.3 
 
 
686 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  33.2 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  44.22 
 
 
277 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  29.84 
 
 
681 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  32.44 
 
 
322 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.36 
 
 
291 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  28.14 
 
 
651 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  32.38 
 
 
692 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  32.66 
 
 
651 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  31.47 
 
 
661 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  30.4 
 
 
319 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 
679 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  32.31 
 
 
722 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  31.79 
 
 
665 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  31.79 
 
 
665 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  31.79 
 
 
665 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.98 
 
 
731 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.63 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  29.84 
 
 
687 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  32.55 
 
 
632 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  37.17 
 
 
664 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.42 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  29.18 
 
 
672 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  30.61 
 
 
739 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  32.64 
 
 
708 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  29.18 
 
 
691 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  32.11 
 
 
671 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  35.75 
 
 
719 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  32.62 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.96 
 
 
675 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  31.12 
 
 
718 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  26.36 
 
 
718 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.41 
 
 
654 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  28.86 
 
 
711 aa  85.9  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.85 
 
 
683 aa  85.5  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  32.05 
 
 
736 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  26.34 
 
 
752 aa  82.8  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  30.26 
 
 
676 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  29.18 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  42.31 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  28.12 
 
 
637 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  27.69 
 
 
641 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  27.69 
 
 
641 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 
642 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  29.59 
 
 
631 aa  75.1  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  28.57 
 
 
671 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  30.5 
 
 
697 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  28.19 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.42 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  28.85 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  27.78 
 
 
394 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  27.8 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  27.8 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  27.8 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.38 
 
 
613 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  31.61 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.08 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  32.95 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 
687 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  31.42 
 
 
708 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.52 
 
 
326 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  27.76 
 
 
322 aa  62  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  25.73 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  29.41 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.1 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  28.16 
 
 
294 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  29.38 
 
 
322 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25.63 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.26 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  26.78 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  27.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  25.86 
 
 
266 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  29.41 
 
 
264 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  28.87 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  28.87 
 
 
290 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  28.72 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  28.9 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  28.9 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  28.9 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  28.17 
 
 
300 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  30.86 
 
 
651 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  27.75 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  26.09 
 
 
328 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  25.6 
 
 
300 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>