23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0072 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0072  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  299  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0377393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3010  hypothetical protein  34.16 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2222  hypothetical protein  36.88 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4540  hypothetical protein  35.44 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4285  hypothetical protein  33.55 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  28.76 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  30.46 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  37.63 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  29.41 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  31.09 
 
 
152 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  29.66 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  29.73 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.45 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  24.5 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1754  hypothetical protein  31.85 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0712518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  31.09 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  29.84 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  29.84 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  29.84 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0299  hypothetical protein  30.99 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  23.61 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  43.1 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  28.42 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>