272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0039 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.26 
 
 
299 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  73.87 
 
 
317 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.38 
 
 
301 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.4 
 
 
293 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
310 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  29.54 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  27.54 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.21 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  29.79 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  29.23 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29.2 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.98 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  30.31 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.46 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.96 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  31.62 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.62 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  28.24 
 
 
359 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  28.24 
 
 
359 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.59 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  25.68 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  27.62 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.7 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  29.68 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  27.55 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  27.16 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.81 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.24 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.81 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  26.98 
 
 
299 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  29.13 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.08 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.49 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.18 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.99 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  26.44 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.32 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.87 
 
 
325 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  26.76 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.52 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.69 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.39 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.17 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  24.49 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.22 
 
 
295 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  29.11 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4399  hypothetical protein  28.4 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  28.09 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  26.67 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  26.58 
 
 
322 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  28.18 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  24.91 
 
 
296 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  29.52 
 
 
379 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.98 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  31.96 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.46 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  46.97 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.31 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  26.85 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  28.94 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  28.17 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.57 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.4 
 
 
367 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  27.53 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  27.73 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  29.74 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.91 
 
 
397 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  24.25 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  27.19 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.76 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  25.1 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  25.26 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  29.65 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.94 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  23.71 
 
 
282 aa  49.3  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.82 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>