46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0023 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0023  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  397  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3428  hypothetical protein  30.34 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3758  hypothetical protein  28.88 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0324  hypothetical protein  34.67 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3514  hypothetical protein  28.49 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00932304  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47340  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0830  YgfB and YecA  37.14 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3154  yecA family protein  28.9 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5026  hypothetical protein  30.64 
 
 
184 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3067  yecA family protein  29.38 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000104077  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3973  yecA family protein  39.25 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00848  yecA family protein  26.14 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3678  YecA family protein  39.25 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5224  hypothetical protein  30.17 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3306  yecA family protein  26.47 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2771  hypothetical protein  33.14 
 
 
178 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2541  yecA family protein  29.3 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.0500855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0320  hypothetical protein  39.36 
 
 
189 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5435  hypothetical protein  30.54 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1184  yecA family protein  29.05 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69010  hypothetical protein  30.2 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5968  hypothetical protein  30.2 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0619  yecA family protein  30 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000645729  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0847  hypothetical protein  32.3 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.110805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3622  yecA family protein  30 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.141978  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3804  yecA family protein  30 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0117458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0614  yecA family protein  30 
 
 
191 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0814334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0605  yecA family protein  24.02 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3214  yecA family protein  28.24 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3504  yecA family protein  29.33 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000256627  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3680  yecA family protein  29.41 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0776  hypothetical protein  29.3 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3503  yecA family protein  25.15 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3334  yecA family protein  29.33 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000512216  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0965  hypothetical protein  31.06 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1822  protein of unknown function UPF0149  30.36 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0327059  hitchhiker  0.0000000200071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2765  YecA family protein  28.39 
 
 
182 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1560  YgfB and YecA  23.08 
 
 
194 aa  52  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.272578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2578  hypothetical protein  30.12 
 
 
176 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.737832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5201  hypothetical protein  28.97 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5108  hypothetical protein  28.97 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.217785  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5261  hypothetical protein  28.04 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0078  hypothetical protein  26.58 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0090  hypothetical protein  26.58 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1769  hypothetical protein  32.26 
 
 
217 aa  42  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.187943  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2051  hypothetical protein  32.26 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.399878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>