More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7275 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  45.03 
 
 		 1142 aa  992    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  43.96 
 
 		 941 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  46.26 
 
 		 1151 aa  989    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.92 
 
 		 1505 aa  687    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  46.15 
 
 		 1135 aa  970    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1138 aa  2346    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  43.95 
 
 		 1182 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  46.48 
 
 		 1143 aa  980    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  51.73 
 
 		 908 aa  884    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  40.74 
 
 		 1444 aa  629  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  40.83 
 
 		 918 aa  625  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 800 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  40.65 
 
 		 984 aa  608  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 918 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  40.93 
 
 		 909 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.29 
 
 		 1200 aa  599  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.3 
 
 		 953 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.1 
 
 		 945 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  30.56 
 
 		 1194 aa  355  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 245 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 272 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.8 
 
 		 232 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  56.28 
 
 		 392 aa  253  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  48.55 
 
 		 247 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  49.77 
 
 		 276 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  42.91 
 
 		 260 aa  207  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  49.53 
 
 		 895 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  43.22 
 
 		 279 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  46.85 
 
 		 275 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  45.81 
 
 		 255 aa  187  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.91 
 
 		 1029 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  37.5 
 
 		 285 aa  169  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 277 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  34.55 
 
 		 292 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  35.29 
 
 		 375 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  27.39 
 
 		 712 aa  136  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  30.38 
 
 		 346 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  25.38 
 
 		 841 aa  129  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  25.49 
 
 		 999 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.17 
 
 		 1657 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  25.49 
 
 		 999 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  27.27 
 
 		 342 aa  118  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.25 
 
 		 442 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.79 
 
 		 396 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  23.64 
 
 		 1081 aa  115  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  24.78 
 
 		 999 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  26.74 
 
 		 585 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  33.9 
 
 		 296 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  27.01 
 
 		 430 aa  105  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  23.73 
 
 		 1132 aa  104  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  30.69 
 
 		 422 aa  101  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.96 
 
 		 369 aa  99.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.09 
 
 		 809 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.6 
 
 		 394 aa  99  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  33.19 
 
 		 419 aa  95.5  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.84 
 
 		 412 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29.89 
 
 		 408 aa  91.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  30.85 
 
 		 471 aa  91.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.59 
 
 		 450 aa  91.3  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.79 
 
 		 520 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.15 
 
 		 414 aa  90.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  43.02 
 
 		 118 aa  89.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  22.3 
 
 		 892 aa  88.6  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  27.38 
 
 		 266 aa  88.2  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  29.83 
 
 		 461 aa  88.2  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  49.35 
 
 		 138 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  28.23 
 
 		 371 aa  87.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.85 
 
 		 387 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0559  cytochrome c551/c552  48.15 
 
 		 121 aa  87.4  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.536891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  24.24 
 
 		 418 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  33.77 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  24.88 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  25.52 
 
 		 972 aa  85.5  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  30.99 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.49 
 
 		 2172 aa  84.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  28 
 
 		 258 aa  84.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  27.51 
 
 		 377 aa  84  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  26.74 
 
 		 306 aa  84.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 360 aa  84  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 381 aa  84  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.52 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  22.54 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  25.82 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  43.37 
 
 		 105 aa  82.4  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.24 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  35.19 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  25.83 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  25.65 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  47.44 
 
 		 110 aa  81.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.52 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  25.18 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.15 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.98 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 110 aa  81.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.47 
 
 		 570 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  23.09 
 
 		 395 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  24.17 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 101 aa  80.1  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 121 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 121 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>