193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7255 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
589 aa  1230    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  47.47 
 
 
592 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  43.97 
 
 
593 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  39.77 
 
 
611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  40 
 
 
629 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  39.26 
 
 
609 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  39.26 
 
 
609 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  39.29 
 
 
609 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  39.69 
 
 
611 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  39.6 
 
 
609 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  40.79 
 
 
609 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  40.97 
 
 
609 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  40.97 
 
 
609 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  38.13 
 
 
616 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  40.79 
 
 
609 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  39.69 
 
 
609 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  40.94 
 
 
616 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  39.18 
 
 
609 aa  435  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  38.84 
 
 
610 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  38.84 
 
 
607 aa  429  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  39.29 
 
 
637 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  39.22 
 
 
635 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  36.22 
 
 
646 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  39.15 
 
 
621 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  37.87 
 
 
611 aa  364  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  36.03 
 
 
585 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  36.67 
 
 
619 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.05 
 
 
1283 aa  341  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  34.16 
 
 
619 aa  338  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  37.02 
 
 
587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.26 
 
 
594 aa  332  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  37.07 
 
 
613 aa  329  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.76 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.45 
 
 
601 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  34.93 
 
 
621 aa  327  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.45 
 
 
601 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  32.37 
 
 
601 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 
603 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.45 
 
 
601 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.97 
 
 
603 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.97 
 
 
603 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.79 
 
 
603 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  36.09 
 
 
590 aa  316  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  34.71 
 
 
605 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  32.87 
 
 
599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  32.76 
 
 
589 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.34 
 
 
599 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  31.47 
 
 
603 aa  312  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.81 
 
 
588 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.35 
 
 
583 aa  312  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  34.14 
 
 
602 aa  307  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  33.58 
 
 
598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.86 
 
 
599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  37.92 
 
 
593 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.99 
 
 
617 aa  301  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  35.02 
 
 
584 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  34.77 
 
 
605 aa  290  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.66 
 
 
595 aa  289  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.15 
 
 
618 aa  289  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  34.3 
 
 
602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.35 
 
 
625 aa  285  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  34.57 
 
 
614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  33.4 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  34.45 
 
 
613 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  33.9 
 
 
627 aa  277  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  33.14 
 
 
613 aa  277  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  34.9 
 
 
616 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  33.98 
 
 
615 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  33.89 
 
 
624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.29 
 
 
628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  35.4 
 
 
608 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  35.79 
 
 
608 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34.9 
 
 
616 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  34.52 
 
 
616 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  34.51 
 
 
616 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  33.4 
 
 
586 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  33.52 
 
 
615 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.38 
 
 
614 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  33.52 
 
 
615 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  34.18 
 
 
614 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  32.47 
 
 
615 aa  267  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  33.98 
 
 
614 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  39.39 
 
 
628 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  33.33 
 
 
611 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.4 
 
 
618 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  33.98 
 
 
617 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  33.14 
 
 
607 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  33.27 
 
 
607 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  33.14 
 
 
607 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  33.08 
 
 
614 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  42.28 
 
 
629 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  39.84 
 
 
625 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  32.52 
 
 
608 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  32.8 
 
 
566 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  33.21 
 
 
622 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.42 
 
 
617 aa  254  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.05 
 
 
621 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  34.64 
 
 
593 aa  252  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.25 
 
 
635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  31.08 
 
 
635 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>