More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7222 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  100 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  41.44 
 
 
255 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  40.45 
 
 
264 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.3 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  40.48 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  39.54 
 
 
255 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  40.91 
 
 
255 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  41.29 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  39.77 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  38.78 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.17 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  39.25 
 
 
255 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  35.8 
 
 
259 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.46 
 
 
255 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.15 
 
 
261 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  37.22 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  36.98 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.26 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  37.78 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  33.58 
 
 
264 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  37.36 
 
 
271 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  38.61 
 
 
272 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
490 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 
251 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  36.3 
 
 
260 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  35.88 
 
 
259 aa  158  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  37.12 
 
 
272 aa  158  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  37.74 
 
 
258 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  36.64 
 
 
262 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  36.26 
 
 
266 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  37.31 
 
 
264 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.84 
 
 
266 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  36.26 
 
 
266 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  36.26 
 
 
266 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  37.45 
 
 
274 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  35.98 
 
 
259 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  31.84 
 
 
266 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  34.98 
 
 
272 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  39.42 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  37.86 
 
 
264 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
536 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  35.96 
 
 
260 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  36.68 
 
 
288 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  36.88 
 
 
253 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  37.63 
 
 
276 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  37.63 
 
 
276 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  39.29 
 
 
292 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  37.63 
 
 
276 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.59 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  36.29 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  35.63 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.6 
 
 
419 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 
273 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.58 
 
 
268 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  38.35 
 
 
263 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  36.29 
 
 
290 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  37.68 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  37.17 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  36.7 
 
 
257 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  37.63 
 
 
276 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  37.35 
 
 
262 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  36.65 
 
 
261 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  35.91 
 
 
288 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  36.78 
 
 
261 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  37.69 
 
 
263 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  39.92 
 
 
274 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.22 
 
 
266 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  36.74 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  34.65 
 
 
252 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  34.35 
 
 
414 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.61 
 
 
283 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  38.81 
 
 
274 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  36.36 
 
 
256 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  38.34 
 
 
271 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  36.6 
 
 
280 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  35.21 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  35.85 
 
 
254 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  36.36 
 
 
260 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  35.63 
 
 
269 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.04 
 
 
308 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  34.98 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  35.16 
 
 
270 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  34.59 
 
 
268 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  36.86 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  36.02 
 
 
264 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  36.26 
 
 
258 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  37.45 
 
 
265 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  34.72 
 
 
275 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  33.06 
 
 
269 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  36.6 
 
 
284 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.83 
 
 
418 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  37.35 
 
 
268 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 
258 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  35.06 
 
 
259 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  35.74 
 
 
272 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  36.36 
 
 
284 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>