More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7155 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  100 
 
 
98 aa  200  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  68.75 
 
 
127 aa  144  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  70.21 
 
 
98 aa  142  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  58.95 
 
 
98 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  59.57 
 
 
101 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  53.57 
 
 
91 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
90 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  52.22 
 
 
98 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  49.45 
 
 
106 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  51.14 
 
 
107 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  48.28 
 
 
106 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  46.59 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  46.59 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  47.83 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  46.39 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  47.42 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  46.59 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  45.65 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  44.32 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  43.75 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  47.78 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  44.32 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  47.25 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  48.89 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  48.89 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  48.89 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  48.89 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  43.18 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  48.89 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  42.39 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  48.89 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  44.32 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  48.94 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  48.89 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  45.56 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  44.33 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  46.67 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  45.65 
 
 
109 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  40.43 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  48.89 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  40.43 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  47.83 
 
 
120 aa  94.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  54.43 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  48.31 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  46.67 
 
 
108 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  41.24 
 
 
104 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  46.67 
 
 
108 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  45.56 
 
 
109 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  46.74 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  42.27 
 
 
107 aa  94  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  48.31 
 
 
103 aa  94  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  46.24 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  42.27 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  47.25 
 
 
109 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  46.74 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  46.74 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  48.35 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  45.56 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  46.15 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  45.56 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  46.15 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  42.22 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  44.57 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  43.3 
 
 
108 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  46.43 
 
 
90 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  38.71 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  44.44 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  47.83 
 
 
146 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.74 
 
 
107 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  39.78 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  39.58 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  51.22 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  46.74 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  47.67 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  41.24 
 
 
238 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  48.42 
 
 
103 aa  92  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  43.33 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  51.22 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  43.33 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  43.33 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  43.33 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  51.22 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  40.82 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>