99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7146 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7146  protein of unknown function DUF1348  100 
 
 
136 aa  278  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0802  protein of unknown function DUF1348  74.26 
 
 
136 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6224  protein of unknown function DUF1348  73.53 
 
 
149 aa  217  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.524129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1334  protein of unknown function DUF1348  74.26 
 
 
141 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1907  protein of unknown function DUF1348  72.06 
 
 
141 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1126  hypothetical protein  70.59 
 
 
155 aa  205  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2261  hypothetical protein  70.59 
 
 
140 aa  203  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  0.0392476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2964  hypothetical protein  77.21 
 
 
137 aa  202  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1931  hypothetical protein  72.73 
 
 
157 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7843  hypothetical protein  71.32 
 
 
153 aa  201  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3482  hypothetical protein  72.73 
 
 
157 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0639508  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2950  hypothetical protein  69.17 
 
 
158 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1147  hypothetical protein  69.85 
 
 
155 aa  201  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.951304  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3096  hypothetical protein  69.63 
 
 
158 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3095  hypothetical protein  69.63 
 
 
158 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2002  protein of unknown function DUF1348  69.92 
 
 
158 aa  200  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386311  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1039  hypothetical protein  71.97 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1606  protein of unknown function DUF1348  66.91 
 
 
155 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2722  hypothetical protein  68.42 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.857411  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2714  hypothetical protein  69.92 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2878  hypothetical protein  68.89 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.051006  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4646  protein of unknown function DUF1348  66.67 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350473  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4514  protein of unknown function DUF1348  66.67 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1059  protein of unknown function DUF1348  70.54 
 
 
153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2135  protein of unknown function DUF1348  68.89 
 
 
157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1552  protein of unknown function DUF1348  69.92 
 
 
158 aa  196  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1007  hypothetical protein  67.65 
 
 
155 aa  196  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0912  protein of unknown function DUF1348  70.54 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5947  hypothetical protein  69.7 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.392478  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5703  hypothetical protein  69.7 
 
 
159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.176651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4684  hypothetical protein  69.17 
 
 
154 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.787791  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2217  hypothetical protein  70.45 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5318  hypothetical protein  67.16 
 
 
159 aa  194  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4893  hypothetical protein  67.16 
 
 
159 aa  194  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4515  hypothetical protein  67.41 
 
 
159 aa  194  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0502513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2439  protein of unknown function DUF1348  66.67 
 
 
157 aa  192  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3017  hypothetical protein  67.91 
 
 
159 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5707  hypothetical protein  67.91 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241094 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5951  hypothetical protein  67.91 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0717221  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1555  protein of unknown function DUF1348  67.94 
 
 
154 aa  191  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94764  hitchhiker  0.00210584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1522  hypothetical protein  66.91 
 
 
156 aa  191  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7000  protein of unknown function DUF1348  66.42 
 
 
159 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71230  hypothetical protein  68.7 
 
 
156 aa  190  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4975  hypothetical protein  65.41 
 
 
159 aa  190  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673999  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6181  hypothetical protein  68.7 
 
 
156 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5154  hypothetical protein  65.41 
 
 
159 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5705  hypothetical protein  65.41 
 
 
159 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0343113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3118  hypothetical protein  65.41 
 
 
159 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.49314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4533  hypothetical protein  65.41 
 
 
159 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.870007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3174  hypothetical protein  65.41 
 
 
159 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3327  hypothetical protein  64.66 
 
 
154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121556  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1113  hypothetical protein  66.42 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4163  hypothetical protein  67.91 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620916  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3842  hypothetical protein  66.92 
 
 
153 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5658  hypothetical protein  62.5 
 
 
155 aa  187  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0315796  normal  0.016815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2653  hypothetical protein  63.24 
 
 
155 aa  187  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0650583  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31878  predicted protein  63.7 
 
 
157 aa  186  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0598588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3103  hypothetical protein  65.91 
 
 
154 aa  185  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.45009  normal  0.493959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3423  protein of unknown function DUF1348  65.91 
 
 
154 aa  185  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5027  hypothetical protein  63.7 
 
 
156 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1116  protein of unknown function DUF1348  66.67 
 
 
154 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0042  protein of unknown function DUF1348  64.18 
 
 
155 aa  184  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0011  hypothetical protein  65.41 
 
 
159 aa  184  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1475  hypothetical protein  64.93 
 
 
155 aa  184  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5338  protein of unknown function DUF1348  62.96 
 
 
156 aa  183  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.563767  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3261  hypothetical protein  63.97 
 
 
155 aa  183  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195182  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4732  hypothetical protein  64.93 
 
 
153 aa  183  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.962547  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1516  hypothetical protein  63.91 
 
 
202 aa  182  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1878  hypothetical protein  65.41 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2764  hypothetical protein  64.66 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0012  hypothetical protein  63.91 
 
 
202 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0012  hypothetical protein  63.91 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0009  hypothetical protein  63.91 
 
 
159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1973  hypothetical protein  63.91 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0012  hypothetical protein  63.91 
 
 
159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1437  hypothetical protein  63.91 
 
 
159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1157  hypothetical protein  63.91 
 
 
159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28330  hypothetical protein  63.24 
 
 
152 aa  181  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0182368  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0675  hypothetical protein  63.57 
 
 
153 aa  180  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1105  protein of unknown function DUF1348  64.12 
 
 
157 aa  180  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2665  protein of unknown function DUF1348  66.15 
 
 
162 aa  180  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2347  hypothetical protein  63.43 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5610  hypothetical protein  64.57 
 
 
155 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5318  hypothetical protein  64.57 
 
 
155 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5230  hypothetical protein  64.57 
 
 
155 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2246  hypothetical protein  63.16 
 
 
157 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.123131  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2823  response regulator receiver domain-containing protein  60 
 
 
164 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3483  hypothetical protein  63.91 
 
 
157 aa  178  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2389  hypothetical protein  64.89 
 
 
153 aa  176  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0260048  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4265  hypothetical protein  63.16 
 
 
155 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1296  protein of unknown function DUF1348  63.16 
 
 
155 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.555087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2759  hypothetical protein  60.15 
 
 
153 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000552736  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2837  hypothetical protein  60.15 
 
 
153 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.811384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3432  hypothetical protein  61.07 
 
 
154 aa  171  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0876  protein of unknown function DUF1348  66.39 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1221  hypothetical protein  62.2 
 
 
141 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3296  protein of unknown function DUF1348  68.7 
 
 
135 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  0.440493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2673  hypothetical protein  59.4 
 
 
162 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14634  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01120  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>