More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7124 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
467 aa  952    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  55.13 
 
 
468 aa  533  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.19 
 
 
466 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  54.41 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.39 
 
 
468 aa  512  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.8 
 
 
467 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.21 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.03 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.46 
 
 
581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.08 
 
 
467 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.47 
 
 
462 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
462 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.27 
 
 
469 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
467 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.04 
 
 
462 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.6 
 
 
468 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.37 
 
 
466 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.48 
 
 
467 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.48 
 
 
467 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  47.49 
 
 
500 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.49 
 
 
466 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
467 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 
467 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.39 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.39 
 
 
468 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 
467 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.85 
 
 
466 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  46.91 
 
 
464 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 
480 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
467 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.07 
 
 
468 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.63 
 
 
468 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.71 
 
 
466 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.12 
 
 
463 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.29 
 
 
462 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.58 
 
 
470 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.15 
 
 
483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.12 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.51 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
478 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
476 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 
476 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
476 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.26 
 
 
462 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.35 
 
 
466 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.98 
 
 
467 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.71 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  45.73 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.96 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.88 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.71 
 
 
466 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.54 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 
476 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.71 
 
 
466 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
478 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 
476 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
478 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 
467 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
476 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 
476 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 
476 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.59 
 
 
471 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
478 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 
476 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 
476 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
478 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
478 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 
474 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.61 
 
 
460 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
478 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  42 
 
 
475 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 
470 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
466 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  42 
 
 
480 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.84 
 
 
459 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  45.18 
 
 
504 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 
481 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
478 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 
475 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.67 
 
 
481 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.47 
 
 
496 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>