174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7122 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7122  OsmC family protein  100 
 
 
171 aa  353  7e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7145  OsmC family protein  51.77 
 
 
138 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2339  OsmC family protein  52.17 
 
 
136 aa  134  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  50.35 
 
 
144 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  50 
 
 
143 aa  126  2e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  49.63 
 
 
141 aa  121  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  48.85 
 
 
140 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  48.12 
 
 
141 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  48.85 
 
 
140 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  48.12 
 
 
141 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  43.97 
 
 
140 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0488  OsmC family protein  48.09 
 
 
140 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.358629  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2261  OsmC family protein  50.78 
 
 
143 aa  117  8e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.427996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2726  peroxiredoxin, OsmC subfamily  46.32 
 
 
138 aa  116  1e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  42.86 
 
 
140 aa  115  2e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0144  OsmC family protein  45.93 
 
 
141 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30653  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  45.99 
 
 
138 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  48.95 
 
 
145 aa  115  4e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2579  OsmC family protein  50 
 
 
143 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0381  OsmC family protein  46.09 
 
 
136 aa  114  8e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2304  OsmC family protein  50 
 
 
143 aa  112  2e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  hitchhiker  0.00777358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  44.27 
 
 
143 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  44.27 
 
 
143 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  44.44 
 
 
145 aa  110  1e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  45.32 
 
 
143 aa  109  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  44.2 
 
 
143 aa  109  2e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  44.29 
 
 
143 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  44.06 
 
 
141 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  44.29 
 
 
143 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  44.76 
 
 
141 aa  108  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  44.76 
 
 
141 aa  108  4e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  44.76 
 
 
141 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.09604e-07 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2586  OsmC family protein  46.83 
 
 
139 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  45.83 
 
 
141 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5587  peroxiredoxin, OsmC subfamily  46.88 
 
 
145 aa  107  8e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0956  OsmC family protein  45.83 
 
 
145 aa  107  9e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4453  OsmC family protein  44.62 
 
 
141 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03308  osmotically inducible protein  48.7 
 
 
144 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3240  OsmC-like protein  41.38 
 
 
146 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  45.04 
 
 
143 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  41.61 
 
 
161 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  40.79 
 
 
151 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5223  OsmC family protein  53.26 
 
 
141 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610628  normal  0.18726 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  43.61 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  46.92 
 
 
140 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  43.61 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  45.32 
 
 
140 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  42.66 
 
 
141 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  42.96 
 
 
144 aa  101  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  43.94 
 
 
165 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2450  OsmC family protein  42.14 
 
 
143 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1350  OsmC family protein  43.48 
 
 
138 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  39.23 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1780  peroxiredoxin OsmC  38.46 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.778339  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  39.23 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  39.23 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  39.23 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1677  peroxiredoxin OsmC  38.46 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  39.23 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1740  peroxiredoxin OsmC  38.46 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  39.23 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1679  peroxiredoxin OsmC  38.46 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1745  peroxiredoxin OsmC  38.46 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1602  peroxiredoxin OsmC  38.46 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.746338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2232  OsmC family protein  45.8 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0526  OsmC-like protein protein  41.67 
 
 
145 aa  99  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.455269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1962  OsmC family protein  43.07 
 
 
141 aa  98.2  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000828142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  43.48 
 
 
146 aa  98.2  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2091  Peroxiredoxin  39.23 
 
 
142 aa  98.2  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.481334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  41.22 
 
 
142 aa  97.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0742  OsmC-like protein  43.65 
 
 
143 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2094  peroxiredoxin OsmC  38.46 
 
 
143 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2067  OsmC-like protein  40.14 
 
 
141 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1377  OsmC family protein  40.88 
 
 
141 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37030  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.91 
 
 
143 aa  95.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0241406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6705  OsmC-like protein  42.22 
 
 
142 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252159  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3669  OsmC family protein  44.7 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1609  OsmC family protein  42.96 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1158  OsmC-like protein  36.81 
 
 
143 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1603  OsmC family protein  41.91 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85336e-11 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5540  peroxiredoxin, OsmC subfamily  41.79 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2374  OsmC-like protein  43.51 
 
 
142 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1108  OsmC family protein  43.07 
 
 
139 aa  92.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  39.2 
 
 
142 aa  91.3  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32410  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.46 
 
 
146 aa  90.9  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0697  putative ATP/GTP binding protein  39.86 
 
 
141 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  39.29 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2843  osmotically inducible protein  38.41 
 
 
139 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0962  OsmC family protein  45.39 
 
 
142 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4494  OsmC family protein  40.88 
 
 
143 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.015469 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  39.69 
 
 
143 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0060  OsmC family protein  42.22 
 
 
141 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4020  OsmC family protein  39.29 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216062  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0859  OsmC family protein  37.59 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407191  normal  0.674013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1608  OsmC family protein  41.18 
 
 
142 aa  86.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.486647  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3986  OsmC-like protein  41.94 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.347334 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0059  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.29 
 
 
145 aa  85.9  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00217443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2716  peroxiredoxin, OsmC subfamily  41.09 
 
 
139 aa  85.1  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.126465  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1401  OsmC-like protein  41.13 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1421  OsmC-like protein  41.13 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>