More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7121 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  100 
 
 
327 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  72.47 
 
 
322 aa  488  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  69.03 
 
 
315 aa  437  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  68.06 
 
 
323 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  66.34 
 
 
320 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  64.82 
 
 
314 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  65.06 
 
 
326 aa  414  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  63.87 
 
 
313 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  62.58 
 
 
315 aa  402  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  57.42 
 
 
334 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  61.29 
 
 
315 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  58.2 
 
 
313 aa  373  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  53.57 
 
 
314 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  53.25 
 
 
314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.33 
 
 
311 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.84 
 
 
311 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  54.07 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.13 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  55.52 
 
 
460 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  53.23 
 
 
314 aa  342  7e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
319 aa  342  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  51.67 
 
 
311 aa  338  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53.57 
 
 
314 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  51.42 
 
 
319 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  53 
 
 
311 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.94 
 
 
311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  51.58 
 
 
319 aa  335  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  53 
 
 
321 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
322 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
322 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
322 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
322 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
322 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  52.37 
 
 
319 aa  332  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53 
 
 
311 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  52.2 
 
 
321 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.89 
 
 
321 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
321 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
321 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  51.89 
 
 
321 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
321 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
321 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  51.61 
 
 
324 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
321 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  51.17 
 
 
311 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  51.09 
 
 
324 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  51.72 
 
 
318 aa  329  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  51.42 
 
 
321 aa  329  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  51.96 
 
 
332 aa  329  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  50.63 
 
 
316 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
323 aa  328  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  49.68 
 
 
323 aa  328  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  51.75 
 
 
320 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
324 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
324 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  51.28 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  51.26 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  51.1 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  52.68 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  52.37 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  51.59 
 
 
453 aa  326  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  53.27 
 
 
456 aa  325  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  50.16 
 
 
319 aa  325  5e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  51.8 
 
 
324 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  51.57 
 
 
316 aa  325  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
314 aa  325  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
325 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  51.59 
 
 
314 aa  324  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  50.79 
 
 
320 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
320 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
320 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  51.31 
 
 
326 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
320 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  50.94 
 
 
323 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
319 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
320 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  51.44 
 
 
316 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  50.78 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  51.1 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  51.1 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  48.23 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  49.04 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  48.9 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  51.48 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  49.18 
 
 
321 aa  320  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
316 aa  319  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
321 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  48.41 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.59 
 
 
458 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  49.18 
 
 
321 aa  318  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
320 aa  318  6e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  50.95 
 
 
317 aa  318  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
316 aa  318  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  50 
 
 
312 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  50 
 
 
317 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  51.63 
 
 
325 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  50 
 
 
317 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
335 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  51.1 
 
 
317 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>