More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7102 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0933  elongation factor G  47.34 
 
 		 719 aa  703    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  100 
 
 		 710 aa  1476    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  44.38 
 
 		 707 aa  640    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  39.97 
 
 		 691 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  40.57 
 
 		 691 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  40.2 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  40 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  39.83 
 
 		 690 aa  538  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  39.86 
 
 		 690 aa  532  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  39.43 
 
 		 693 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  39.72 
 
 		 699 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  36.16 
 
 		 696 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  36.19 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.41 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  36.43 
 
 		 694 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  34.95 
 
 		 695 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  37.15 
 
 		 680 aa  469  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  35.92 
 
 		 695 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  38.29 
 
 		 701 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  37.9 
 
 		 703 aa  459  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  37.9 
 
 		 701 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  36.76 
 
 		 682 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  35.47 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  34.76 
 
 		 673 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.52 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  36.83 
 
 		 701 aa  442  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  33.99 
 
 		 673 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  34.45 
 
 		 667 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  34.09 
 
 		 683 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  34.55 
 
 		 691 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 697 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.1 
 
 		 701 aa  432  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  34.61 
 
 		 695 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  34.09 
 
 		 688 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.96 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  33.52 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  33.24 
 
 		 686 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  34.38 
 
 		 692 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  34.19 
 
 		 697 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  34.19 
 
 		 697 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  33.47 
 
 		 701 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  33.9 
 
 		 689 aa  419  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  34.29 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  33.29 
 
 		 696 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.31 
 
 		 682 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  33.61 
 
 		 696 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.22 
 
 		 694 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  33.62 
 
 		 697 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  32.34 
 
 		 696 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  34.51 
 
 		 706 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  34.14 
 
 		 691 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  33.85 
 
 		 694 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  33.99 
 
 		 701 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.67 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  34.89 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  32.73 
 
 		 692 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  32.21 
 
 		 697 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  33.85 
 
 		 697 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  32.96 
 
 		 697 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  33.62 
 
 		 695 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  32.39 
 
 		 696 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  35.04 
 
 		 703 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.23 
 
 		 697 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  33.95 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  34.18 
 
 		 692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  33.95 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  32.81 
 
 		 692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  33.05 
 
 		 696 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  33.85 
 
 		 701 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  32.4 
 
 		 697 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.62 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  32.96 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  32.29 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  33.01 
 
 		 697 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  34.23 
 
 		 687 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03950  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.94 
 
 		 698 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  34.28 
 
 		 693 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  33 
 
 		 698 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  33.24 
 
 		 704 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  32.95 
 
 		 691 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  32.53 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  32.15 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.07 
 
 		 692 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  33.57 
 
 		 683 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  32.91 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  32.16 
 
 		 697 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  32.86 
 
 		 698 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  32.03 
 
 		 705 aa  399  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  33.14 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  32.29 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  31.59 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  31.83 
 
 		 695 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  33.47 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  32.86 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  32.82 
 
 		 692 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  32.15 
 
 		 699 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  33.19 
 
 		 698 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  32.53 
 
 		 692 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  32.86 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>