32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7038 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  67.39 
 
 		 932 aa  1312    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  61.99 
 
 		 910 aa  1192    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 923 aa  1905    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  46.63 
 
 		 931 aa  796    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  67.18 
 
 		 942 aa  1284    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  29.58 
 
 		 906 aa  356  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.63 
 
 		 874 aa  261  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  26.03 
 
 		 923 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  24.24 
 
 		 983 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.54 
 
 		 863 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.53 
 
 		 911 aa  94.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  28.52 
 
 		 840 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.23 
 
 		 837 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1057 aa  88.6  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.15 
 
 		 885 aa  84  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.13 
 
 		 887 aa  84  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  27.12 
 
 		 871 aa  83.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.05 
 
 		 829 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  25.17 
 
 		 858 aa  80.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.09 
 
 		 862 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.76 
 
 		 860 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.58 
 
 		 850 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.71 
 
 		 845 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.5 
 
 		 848 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.02 
 
 		 852 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  23.98 
 
 		 816 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.92 
 
 		 834 aa  67.8  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.61 
 
 		 848 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  27.54 
 
 		 836 aa  62  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  22.95 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.1 
 
 		 831 aa  55.1  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.24 
 
 		 568 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>