More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7018 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
187 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  75.42 
 
 
182 aa  296  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  75.42 
 
 
180 aa  295  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  75.57 
 
 
180 aa  293  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.19 
 
 
181 aa  286  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  77.19 
 
 
181 aa  286  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  57.05 
 
 
168 aa  208  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.77 
 
 
230 aa  204  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  51.59 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  51.59 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  53.29 
 
 
182 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.59 
 
 
183 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.28 
 
 
181 aa  191  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  49.68 
 
 
185 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  51.28 
 
 
184 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  51.28 
 
 
184 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.34 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.34 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.34 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.61 
 
 
184 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.85 
 
 
170 aa  188  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.16 
 
 
170 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  52.74 
 
 
184 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  48.45 
 
 
216 aa  184  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.79 
 
 
170 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
179 aa  184  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.68 
 
 
183 aa  184  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  56.16 
 
 
170 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  48.72 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  50.64 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  48.72 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.42 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.78 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  46.2 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 
184 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.72 
 
 
226 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  52.32 
 
 
213 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  55.48 
 
 
170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  50.96 
 
 
193 aa  181  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.3 
 
 
183 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1279  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 
182 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1380  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.1 
 
 
202 aa  178  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
183 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  49.34 
 
 
167 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.68 
 
 
183 aa  178  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2569  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 
182 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.41 
 
 
793 aa  177  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
226 aa  177  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  53.57 
 
 
179 aa  177  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  49.66 
 
 
182 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.14 
 
 
792 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.48 
 
 
791 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
226 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 
183 aa  176  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.45 
 
 
179 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  51.08 
 
 
213 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  48.68 
 
 
199 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.32 
 
 
794 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  48.37 
 
 
264 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  55.38 
 
 
222 aa  175  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  48.03 
 
 
184 aa  175  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.17 
 
 
183 aa  175  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  55.38 
 
 
222 aa  174  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 
159 aa  174  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
167 aa  174  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  55.38 
 
 
222 aa  174  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
178 aa  174  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 
159 aa  174  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.63 
 
 
794 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1014  NADH dehydrogenase subunit B  48.1 
 
 
221 aa  174  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.12 
 
 
180 aa  174  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  50.35 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.06 
 
 
794 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  47.71 
 
 
271 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  48.1 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  46.5 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4520  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.38 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  48.1 
 
 
159 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  46.84 
 
 
159 aa  171  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 
264 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  50.67 
 
 
268 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 
220 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.34 
 
 
194 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  48.61 
 
 
224 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0717  NADH dehydrogenase subunit B  52.99 
 
 
211 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>