More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6995 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  293  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 146 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  46.62 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  40.54 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  44.03 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.05 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 171 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.01 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  35.46 
 
 		 191 aa  93.6  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  35.33 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  37.8 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.19 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  32.43 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  35.37 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 152 aa  92  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.25 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  37.98 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  36.77 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  31.08 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 167 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  38.4 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  32.19 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  31.76 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  35.43 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  29.73 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  42.19 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  38.58 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  38.28 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  31.97 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  39.84 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.11 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  34.88 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  37.01 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  36.77 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.01 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  38.58 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.28 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  38.58 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  38.58 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  38.28 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  28.28 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  38.28 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  30.82 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  36.09 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  34.35 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  34.21 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 170 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>