More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6994 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  100 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  65.22 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  65.88 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  79.71 
 
 		 83 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  72.29 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  63.41 
 
 		 100 aa  113  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  71.01 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  61.36 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  68.12 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 78 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 80 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  63.93 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  63.93 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  50.79 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  57.38 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  47.37 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  51.56 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  50.67 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  46.88 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  45.59 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5729  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237828  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  46.05 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0243  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.783981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>