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for query gene Cpin_6989 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 568 aa  1180    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  51.24 
 
 		 574 aa  615  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.19 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.2 
 
 		 568 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  51.39 
 
 		 568 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.09 
 
 		 584 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.53 
 
 		 567 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  49.82 
 
 		 566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.28 
 
 		 564 aa  548  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.22 
 
 		 584 aa  527  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.55 
 
 		 587 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.88 
 
 		 571 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.38 
 
 		 570 aa  461  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.67 
 
 		 568 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  40.43 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.39 
 
 		 907 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.01 
 
 		 574 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.16 
 
 		 885 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.56 
 
 		 573 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  38.31 
 
 		 568 aa  405  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.6 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.14 
 
 		 827 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.96 
 
 		 574 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  35.02 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 814 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.92 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.49 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.13 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.71 
 
 		 831 aa  363  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37.29 
 
 		 932 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.8 
 
 		 788 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.21 
 
 		 572 aa  360  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.16 
 
 		 570 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 785 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.63 
 
 		 798 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.04 
 
 		 572 aa  353  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.74 
 
 		 779 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.56 
 
 		 779 aa  349  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 573 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 573 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.39 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.92 
 
 		 779 aa  347  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.92 
 
 		 773 aa  347  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.21 
 
 		 779 aa  346  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.21 
 
 		 779 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.53 
 
 		 569 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.21 
 
 		 779 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.21 
 
 		 779 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.49 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.12 
 
 		 989 aa  345  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 564 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.04 
 
 		 779 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.94 
 
 		 566 aa  343  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 		 779 aa  343  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.04 
 
 		 811 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.64 
 
 		 566 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.17 
 
 		 566 aa  336  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.02 
 
 		 801 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.55 
 
 		 573 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  37.29 
 
 		 742 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 655 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 654 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 655 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.19 
 
 		 576 aa  322  8e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.31 
 
 		 579 aa  322  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.76 
 
 		 732 aa  316  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 977 aa  312  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.24 
 
 		 1035 aa  312  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.21 
 
 		 857 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.61 
 
 		 583 aa  309  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.59 
 
 		 592 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.93 
 
 		 865 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.78 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  31.52 
 
 		 684 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.58 
 
 		 1120 aa  302  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0909  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.67 
 
 		 911 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.65 
 
 		 573 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.78 
 
 		 1134 aa  299  7e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.46 
 
 		 864 aa  299  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.32 
 
 		 763 aa  299  9e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  31.45 
 
 		 655 aa  297  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.81 
 
 		 1102 aa  297  4e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  33.16 
 
 		 736 aa  297  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.7 
 
 		 578 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 577 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 577 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.88 
 
 		 574 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  31.8 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.21 
 
 		 574 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.94 
 
 		 955 aa  293  6e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  32.82 
 
 		 577 aa  292  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.21 
 
 		 574 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 955 aa  292  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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