More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6938 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 
247 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  38.93 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
239 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
255 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
265 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  27.8 
 
 
264 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
255 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.65 
 
 
289 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
280 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
266 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  29.51 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.25 
 
 
259 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.74 
 
 
263 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
266 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
265 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  30 
 
 
263 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.45 
 
 
266 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
245 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
264 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.2 
 
 
248 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
277 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
261 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
263 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
263 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
262 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
265 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.16 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.1 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
237 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 
263 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  24.69 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.03 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.7 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  30.69 
 
 
256 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.71 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 
231 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
261 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 
261 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
263 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.86 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  31.02 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
259 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.98 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.82 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.69 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.79 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  23.61 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
340 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  23.18 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.5 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.5 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  23.18 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  23.08 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.14 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.17 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.77 
 
 
425 aa  79  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>