More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6701 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
271 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
267 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
272 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 
272 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 
268 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.61 
 
 
273 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
268 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
268 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
268 aa  208  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  41.56 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  39.06 
 
 
277 aa  182  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
273 aa  178  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  41 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  40.29 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
272 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
273 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
317 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
276 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
287 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
278 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  39.2 
 
 
244 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
284 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
249 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
278 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 
283 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
286 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.4 
 
 
273 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
242 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.67 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
245 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.32 
 
 
276 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
271 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
277 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
280 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
279 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
289 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
267 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
267 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
338 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
276 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
280 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  44.5 
 
 
286 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
285 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
291 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
256 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
291 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
277 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
282 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
274 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
276 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
291 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
281 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
276 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  43.14 
 
 
276 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  38.6 
 
 
282 aa  151  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  42.65 
 
 
276 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
275 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
291 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
279 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
269 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
278 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
287 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
287 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
247 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  34.39 
 
 
275 aa  148  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
280 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  43.39 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
293 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
280 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.93 
 
 
271 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  35.37 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  40 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>