More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6624 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 650 aa  1340    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  45.13 
 
 		 1015 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  43.89 
 
 		 1051 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  42.92 
 
 		 1192 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  28.01 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  39.82 
 
 		 975 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  26.84 
 
 		 671 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  40.18 
 
 		 1182 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  37.93 
 
 		 631 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  39.29 
 
 		 684 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  26.83 
 
 		 675 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  38.65 
 
 		 304 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  35.11 
 
 		 541 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0672  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 289 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 961 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2657  signal transduction histidine kinase, LytS  33.03 
 
 		 478 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.8 
 
 		 782 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  34.52 
 
 		 612 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  34.11 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  35.19 
 
 		 587 aa  104  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1238 aa  104  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  30.94 
 
 		 360 aa  100  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 		 985 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 408 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 388 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  27.69 
 
 		 374 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 545 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  31.14 
 
 		 398 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 390 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  28.96 
 
 		 408 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  32.46 
 
 		 600 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  34.84 
 
 		 390 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 		 1180 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  32.7 
 
 		 603 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  36.6 
 
 		 578 aa  98.2  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  31.22 
 
 		 372 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  25.81 
 
 		 941 aa  97.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  27.6 
 
 		 381 aa  97.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 357 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  25.08 
 
 		 667 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 1060 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  32.05 
 
 		 414 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  30.56 
 
 		 488 aa  96.3  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 585 aa  96.3  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  36.81 
 
 		 603 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 		 367 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  37.5 
 
 		 455 aa  95.5  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.72 
 
 		 828 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1101 aa  94.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  34.46 
 
 		 366 aa  94.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  32.54 
 
 		 595 aa  94  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  25.8 
 
 		 616 aa  94  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 		 809 aa  94  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1313 aa  93.6  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 654 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 411 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  33.95 
 
 		 369 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  30.48 
 
 		 380 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 394 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  34.19 
 
 		 428 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 		 568 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  26.85 
 
 		 428 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  33.78 
 
 		 586 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  26.51 
 
 		 1147 aa  92  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  26.52 
 
 		 516 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  30.63 
 
 		 374 aa  92  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 433 aa  92.4  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.82 
 
 		 2145 aa  92  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 374 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  34.72 
 
 		 591 aa  91.3  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 394 aa  91.3  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 438 aa  91.3  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 		 394 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  34.94 
 
 		 465 aa  91.3  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 410 aa  90.9  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  29.1 
 
 		 443 aa  90.9  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  29.61 
 
 		 338 aa  90.9  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 552 aa  90.9  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  33.54 
 
 		 393 aa  90.5  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 580 aa  90.5  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1550 aa  90.5  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  31.31 
 
 		 420 aa  90.5  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  28.04 
 
 		 389 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.95 
 
 		 414 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 571 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  31.05 
 
 		 400 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  30.08 
 
 		 607 aa  90.5  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.71 
 
 		 1266 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 		 408 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 		 580 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  33.99 
 
 		 576 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 436 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  33.19 
 
 		 610 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 576 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 412 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>