68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6572 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6572  methyltransferase  100 
 
 		 297 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  38.95 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  37.11 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  29.78 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  24.49 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  26.18 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  28.73 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  26.12 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  27.51 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  27.88 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  33.89 
 
 		 209 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  25.44 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3997  putative methyltransferase  26.18 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263514  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  25.27 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  31.67 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  22.57 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  28.39 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  25.52 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  25.4 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  25.82 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  24.27 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  26.15 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  28.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0164  putative methyltransferase  26.39 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  27.18 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  25.25 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  26.7 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 648 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  26.63 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  25.14 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 659 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 604 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 604 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  21.77 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 604 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0683  methyltransferase  26.56 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5836  putative methyltransferase  29.46 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 604 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 630 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 630 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  25.98 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  20.81 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  25.22 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0649  methyltransferase  26.16 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  29.93 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  29.93 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  29.93 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  24.63 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  24.63 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  24.14 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  26.86 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  26.42 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11980  hypothetical protein  26 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  24.63 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  24.63 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 639 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1100  hypothetical protein  26 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0165412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  26.09 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  26.57 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  28.45 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  29.13 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  28.1 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  28.1 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  26.28 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  28.1 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  34.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30355  predicted protein  24.55 
 
 		 260 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.074058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>