181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6497 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 442 aa  907    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  33.79 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  31.34 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  32.13 
 
 		 469 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  31.3 
 
 		 471 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  30.3 
 
 		 469 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  32.27 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  30.13 
 
 		 495 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  31.81 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  30.07 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  30.07 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  28.34 
 
 		 475 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  30.35 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  29.13 
 
 		 469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  29.85 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  28.29 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.16 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  29.18 
 
 		 509 aa  182  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  28.13 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  28.21 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  29.9 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  26.39 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  25.32 
 
 		 488 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  29.01 
 
 		 479 aa  156  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  27.43 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  28.14 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  28.54 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  27.21 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  28.23 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  28.02 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  28.02 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  28.02 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  28.29 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  28.08 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  26.73 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  28.08 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  27.09 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  23.97 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  23.76 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  23.76 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  23.76 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  27.35 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  23.97 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  23.76 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  24.15 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  23.11 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  26.53 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  23.54 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  23.54 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  26.65 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  25.34 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  26.2 
 
 		 459 aa  123  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  25.5 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  24.08 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  29.49 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  26.89 
 
 		 454 aa  113  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  23.65 
 
 		 479 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  23.77 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  23.68 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  30.56 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  23 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  26.54 
 
 		 463 aa  97.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  24.12 
 
 		 470 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  24.54 
 
 		 493 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  21.74 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 473 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  24.66 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  24.18 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  29.44 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.3 
 
 		 589 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  22.83 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  25.18 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.85 
 
 		 722 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  22.6 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  24.82 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  22.02 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  22.57 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  23.52 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  22.42 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  25.19 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  23.67 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  26.98 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  29.17 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 502 aa  57  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>