More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6386 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  100 
 
 
394 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  49.21 
 
 
412 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  49.37 
 
 
397 aa  358  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  44.92 
 
 
393 aa  345  8e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  45.31 
 
 
399 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  45.67 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  45.04 
 
 
397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  44.5 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  45.86 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  45.5 
 
 
396 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  45.24 
 
 
396 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  44.78 
 
 
394 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  45.36 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  44.25 
 
 
402 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  45.24 
 
 
396 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  43.3 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  39.9 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  44.9 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  41.71 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  43.04 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  41.79 
 
 
405 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  43.72 
 
 
398 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  40.75 
 
 
403 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  43.88 
 
 
390 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  42.78 
 
 
400 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  41.07 
 
 
392 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  45.41 
 
 
393 aa  298  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  40.51 
 
 
393 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  40.51 
 
 
393 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  42.71 
 
 
411 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  43.72 
 
 
402 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  43.65 
 
 
393 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  42.56 
 
 
391 aa  296  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  41.48 
 
 
398 aa  295  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  41.84 
 
 
389 aa  295  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  40.46 
 
 
382 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  41.48 
 
 
407 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  42.5 
 
 
398 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  42.21 
 
 
398 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  42.32 
 
 
401 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  40.67 
 
 
394 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  40.83 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  41.79 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  42.75 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  41.94 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  40.25 
 
 
405 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  40.92 
 
 
396 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  41.67 
 
 
399 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  39.19 
 
 
1305 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  41.03 
 
 
400 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  40.74 
 
 
405 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  40.26 
 
 
400 aa  279  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  40.31 
 
 
397 aa  278  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  43.22 
 
 
402 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  43.22 
 
 
402 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  40.83 
 
 
397 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  40.66 
 
 
398 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  40.57 
 
 
397 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  40.31 
 
 
397 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  40.31 
 
 
397 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  41.41 
 
 
404 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  40.57 
 
 
397 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  40.66 
 
 
398 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  40.31 
 
 
397 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  40 
 
 
416 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  40.05 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  40.05 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  40.05 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  38.83 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  38.4 
 
 
408 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  39.04 
 
 
412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  37.78 
 
 
402 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  39.9 
 
 
371 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  37.72 
 
 
398 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  39.79 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  42.27 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  41.07 
 
 
399 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  40.35 
 
 
398 aa  268  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  39.39 
 
 
405 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  37.88 
 
 
410 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  37.72 
 
 
401 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  38.85 
 
 
406 aa  266  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  39.05 
 
 
404 aa  266  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  39.49 
 
 
401 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  41.15 
 
 
401 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  40.2 
 
 
1230 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  39.79 
 
 
397 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  38.04 
 
 
404 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  40.26 
 
 
400 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  40.36 
 
 
399 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  37.75 
 
 
400 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2716  acetate kinase  39.8 
 
 
408 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  39.55 
 
 
422 aa  262  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  40.92 
 
 
400 aa  262  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  36.93 
 
 
402 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  41.16 
 
 
399 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  40.84 
 
 
399 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  41.16 
 
 
399 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  37.78 
 
 
401 aa  260  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>