More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6280 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  100 
 
 
393 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  48.77 
 
 
371 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  35.99 
 
 
379 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  28.34 
 
 
381 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  30.93 
 
 
603 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  30.93 
 
 
603 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  26.02 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.41 
 
 
386 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.35 
 
 
660 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  34.18 
 
 
716 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  33.95 
 
 
685 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  36.2 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  26.53 
 
 
690 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  29.67 
 
 
710 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  31.38 
 
 
634 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  29.67 
 
 
710 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  31.96 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.87 
 
 
660 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27 
 
 
616 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  29.67 
 
 
339 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.66 
 
 
638 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  34.34 
 
 
742 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  27.66 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  35 
 
 
695 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  28.74 
 
 
671 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  25.32 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  38.12 
 
 
665 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  35.45 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  36.77 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  35.29 
 
 
625 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  26.99 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  35.93 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  28.87 
 
 
604 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  28.87 
 
 
604 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  24.1 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  33.33 
 
 
675 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  32.12 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  29.45 
 
 
635 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  26.7 
 
 
662 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.06 
 
 
679 aa  79.7  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  26.79 
 
 
615 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  33.54 
 
 
641 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  25 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  35.9 
 
 
777 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  30.52 
 
 
621 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  37.5 
 
 
662 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  36.2 
 
 
658 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  37.75 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  28.46 
 
 
584 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  36.31 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  31.72 
 
 
690 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  38.1 
 
 
690 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.12 
 
 
656 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  28.49 
 
 
604 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  23.67 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  33.13 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  28.03 
 
 
637 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  36.9 
 
 
662 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  31.76 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  36.09 
 
 
679 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  29.23 
 
 
640 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  36.84 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  33.13 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  34.09 
 
 
632 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  37.87 
 
 
690 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  37.89 
 
 
656 aa  76.6  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  33.33 
 
 
977 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  35.4 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  35.76 
 
 
660 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  34.04 
 
 
635 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  29.64 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  33.13 
 
 
710 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  25.94 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  29.41 
 
 
607 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  27.99 
 
 
711 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  35.95 
 
 
681 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3854  putative acyltransferase  28.53 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  28.62 
 
 
642 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.81 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  26.87 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  34.52 
 
 
734 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  32.87 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.81 
 
 
675 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  33.7 
 
 
658 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  34.16 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  32.21 
 
 
720 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  32.3 
 
 
632 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  27.97 
 
 
675 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  26.86 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  32.61 
 
 
720 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  27.46 
 
 
718 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  27.37 
 
 
632 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  29.06 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  27.95 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  38.18 
 
 
645 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  29.34 
 
 
627 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  32.08 
 
 
671 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.63 
 
 
660 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  34.87 
 
 
682 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.33 
 
 
629 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>