48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6271 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  100 
 
 
663 aa  1374    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  67.27 
 
 
656 aa  922    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  64.36 
 
 
647 aa  846    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  67.33 
 
 
669 aa  913    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  50.55 
 
 
722 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  46.27 
 
 
673 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  46.86 
 
 
669 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  38.54 
 
 
506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  33.71 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.64 
 
 
491 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  34.4 
 
 
502 aa  260  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  24.29 
 
 
1010 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  47.52 
 
 
129 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3610  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  42.37 
 
 
457 aa  88.2  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  23.02 
 
 
920 aa  87.4  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.89 
 
 
377 aa  54.7  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.38 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  25.25 
 
 
394 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  32.89 
 
 
122 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  43.04 
 
 
106 aa  51.2  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  29.25 
 
 
466 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  32.41 
 
 
1110 aa  49.3  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  27.27 
 
 
135 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  27.22 
 
 
384 aa  47.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.23 
 
 
436 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.48 
 
 
448 aa  47.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28 
 
 
357 aa  47.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  31.76 
 
 
909 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  39.47 
 
 
131 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  32.89 
 
 
104 aa  47.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.39 
 
 
1149 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  39.53 
 
 
105 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  38.46 
 
 
131 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  33.7 
 
 
101 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.79 
 
 
371 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  28.89 
 
 
381 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  35.45 
 
 
102 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  25 
 
 
394 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  27.71 
 
 
363 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  31.4 
 
 
918 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  33.33 
 
 
218 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  32.1 
 
 
1151 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  34.18 
 
 
941 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
115 aa  44.3  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  27.45 
 
 
1439 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
344 aa  43.9  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.86 
 
 
1265 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>