More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6261 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  100 
 
 
298 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  44.1 
 
 
306 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  44.44 
 
 
300 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  43.06 
 
 
285 aa  233  4e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  40.91 
 
 
287 aa  231  8e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  42.03 
 
 
282 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  42.91 
 
 
273 aa  205  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 
314 aa  165  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  31.91 
 
 
313 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  30.59 
 
 
311 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  30.34 
 
 
312 aa  143  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
310 aa  135  1e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.6 
 
 
358 aa  128  1e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  31.56 
 
 
316 aa  127  2e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  32.88 
 
 
310 aa  118  1e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
330 aa  117  2e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
310 aa  113  4e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
317 aa  110  2e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  30.73 
 
 
330 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.76 
 
 
672 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
318 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
353 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.06 
 
 
353 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  30.45 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.11 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.99 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.63 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.12 
 
 
308 aa  85.1  1e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.34 
 
 
240 aa  82  1e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  26.74 
 
 
305 aa  81.6  1e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  32.21 
 
 
336 aa  81.3  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.05 
 
 
342 aa  80.5  3e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 
326 aa  80.1  4e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  26.61 
 
 
236 aa  80.1  4e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.22466e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
323 aa  79  8e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
323 aa  79  8e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.91 
 
 
345 aa  77.8  2e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
333 aa  77.8  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 
326 aa  77  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 
267 aa  77  3e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  24.22 
 
 
306 aa  77  3e-13  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
1177 aa  77  4e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
1177 aa  76.6  5e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
214 aa  76.3  6e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.32 
 
 
346 aa  75.9  8e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
275 aa  75.5  1e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  29.34 
 
 
293 aa  74.3  2e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.7 
 
 
305 aa  74.7  2e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  31.72 
 
 
298 aa  73.9  3e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 
415 aa  73.2  5e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  22.84 
 
 
572 aa  72  1e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  28.51 
 
 
309 aa  71.6  1e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  31.54 
 
 
323 aa  71.2  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  21.16 
 
 
306 aa  69.3  7e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 
310 aa  67.8  2e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  21.6 
 
 
310 aa  67.4  3e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  26.28 
 
 
274 aa  66.2  6e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  22.58 
 
 
248 aa  65.5  1e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  8.22833e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
303 aa  65.1  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
251 aa  65.5  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.88 
 
 
297 aa  64.3  2e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.95 
 
 
291 aa  64.7  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  26.3 
 
 
334 aa  64.7  2e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
335 aa  63.2  5e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  25.42 
 
 
574 aa  62  1e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  24.91 
 
 
625 aa  62  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.25 
 
 
303 aa  62.4  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  1.29076e-05 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  24.48 
 
 
286 aa  61.6  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  26.38 
 
 
237 aa  60.5  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.33 
 
 
303 aa  60.1  4e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 
235 aa  59.7  5e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
194 aa  59.3  7e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  24.36 
 
 
281 aa  59.3  7e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.54 
 
 
391 aa  59.3  9e-08  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
241 aa  58.2  2e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  26.29 
 
 
248 aa  58.2  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  26.29 
 
 
248 aa  58.2  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.85 
 
 
229 aa  57.8  2e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  3.72241e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  57  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  25.71 
 
 
248 aa  57.4  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  57.4  3e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  30.93 
 
 
382 aa  56.6  4e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
303 aa  56.6  5e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  24.72 
 
 
222 aa  56.6  5e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
383 aa  56.6  5e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  26.86 
 
 
248 aa  56.6  5e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  22.97 
 
 
513 aa  56.2  7e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 
634 aa  55.8  7e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
1162 aa  55.8  9e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.46 
 
 
239 aa  55.1  1e-06  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 
295 aa  54.7  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  25.34 
 
 
447 aa  55.1  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  26.76 
 
 
307 aa  54.7  2e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  35.71 
 
 
215 aa  55.1  2e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  25.34 
 
 
447 aa  55.1  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  24.72 
 
 
242 aa  54.3  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  27.74 
 
 
407 aa  53.9  3e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  28.89 
 
 
376 aa  53.9  3e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>