228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6212 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  100 
 
 
163 aa  322  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  53.7 
 
 
162 aa  179  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  53.37 
 
 
163 aa  170  7e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
163 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 
161 aa  144  4e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
163 aa  144  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  4.70515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
160 aa  139  1e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  137  4e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  39.51 
 
 
163 aa  138  4e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  137  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
163 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
163 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
163 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  133  1e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
161 aa  132  2e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.32382e-06  hitchhiker  2.62338e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
160 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  131  4e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  3.04548e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  131  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  130  8e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
161 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
161 aa  130  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
161 aa  130  1e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
162 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
160 aa  128  4e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  127  5e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
162 aa  127  7e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
161 aa  127  9e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
161 aa  126  1e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.15495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  5.36011e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  44.72 
 
 
165 aa  126  1e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.72661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  126  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
160 aa  125  2e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  38.89 
 
 
161 aa  125  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  38.89 
 
 
161 aa  125  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
160 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
163 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
163 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
163 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
163 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
159 aa  124  4e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
161 aa  124  4e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.35771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  41.36 
 
 
160 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
159 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  124  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  43.12 
 
 
163 aa  124  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  124  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
160 aa  124  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  44.91 
 
 
165 aa  123  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
161 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
159 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
161 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
161 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
162 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
161 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
162 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
159 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
161 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.79998e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
161 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
164 aa  120  1e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
161 aa  119  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
159 aa  119  2e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
163 aa  119  2e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.20146e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  40.74 
 
 
159 aa  119  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
161 aa  119  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
161 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
161 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
161 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 
161 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
161 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
161 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
161 aa  118  4e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
162 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
165 aa  117  8e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
160 aa  117  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  9.45037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  41.25 
 
 
164 aa  117  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  116  1e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
161 aa  116  1e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
176 aa  115  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  40.12 
 
 
163 aa  116  2e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
163 aa  116  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  116  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
161 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.33798e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  42.24 
 
 
164 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  40.37 
 
 
165 aa  115  4e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>