69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6205 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 671 aa  1376    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  35.69 
 
 		 598 aa  240  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  35.37 
 
 		 750 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  32.53 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  32.1 
 
 		 477 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  29.68 
 
 		 660 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  30.97 
 
 		 631 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  31.69 
 
 		 651 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  27.6 
 
 		 700 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  33.01 
 
 		 423 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  30.09 
 
 		 619 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  31.29 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.86 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  28.05 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.46 
 
 		 632 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  28.05 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.58 
 
 		 858 aa  82.4  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  28.41 
 
 		 640 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.37 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  29.09 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  27.07 
 
 		 750 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29.13 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  34.81 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.8 
 
 		 462 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  24.52 
 
 		 617 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  25.18 
 
 		 465 aa  73.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  26.43 
 
 		 442 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  27.45 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  27.38 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  27.4 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  26.79 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  24.57 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  25.45 
 
 		 397 aa  66.6  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  25.55 
 
 		 649 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.97 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  29.85 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.01 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  26.77 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0355  hypothetical protein  34 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000024475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  24.12 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  23.08 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  25 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  26.5 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  24.24 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  26.7 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  27.27 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  24.16 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  26.85 
 
 		 403 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  29.03 
 
 		 664 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  30.48 
 
 		 302 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  33.72 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  21.92 
 
 		 413 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  27.08 
 
 		 380 aa  52  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  33.72 
 
 		 585 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  22.02 
 
 		 747 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  22.44 
 
 		 322 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  33.67 
 
 		 299 aa  50.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  27.97 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  20.94 
 
 		 328 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  25.34 
 
 		 509 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  29.29 
 
 		 361 aa  47.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  26.63 
 
 		 447 aa  47.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  32 
 
 		 596 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  24.75 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  26.87 
 
 		 330 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  26.12 
 
 		 330 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>