232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6194 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 379 aa  748    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  49.09 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  51.87 
 
 		 387 aa  356  5e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  47.62 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  49.61 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  50.81 
 
 		 408 aa  342  7e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  48.45 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  43.82 
 
 		 455 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  48.02 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 389 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  46.21 
 
 		 389 aa  312  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.58 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.74 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  43.29 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  42.49 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.24 
 
 		 389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.24 
 
 		 389 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  43.16 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.03 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.24 
 
 		 389 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.97 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.03 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.24 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.91 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.03 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.5 
 
 		 391 aa  301  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.73 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.73 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.73 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.73 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.73 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.84 
 
 		 391 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.62 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.91 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.44 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.21 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  43.42 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.74 
 
 		 382 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  46.17 
 
 		 392 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  47.16 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.71 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  42.92 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.19 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  42.92 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  39.67 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  43.42 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  43.15 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.04 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  43.62 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.46 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  44.85 
 
 		 402 aa  285  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  46.82 
 
 		 399 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.56 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.89 
 
 		 394 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.89 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  44.73 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.62 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.26 
 
 		 397 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  40.91 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.44 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.98 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  44.27 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  39.77 
 
 		 438 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.77 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.36 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.5 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.49 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  40.86 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.82 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  43.68 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.21 
 
 		 401 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.18 
 
 		 391 aa  275  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.6 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.5 
 
 		 420 aa  275  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.08 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  38.23 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  43.24 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  44.47 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.11 
 
 		 382 aa  272  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 472 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  44.22 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  42.23 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  40.61 
 
 		 438 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  42.74 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  38.34 
 
 		 464 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  45.97 
 
 		 408 aa  269  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.77 
 
 		 398 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.51 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.63 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.67 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.04 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.33 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>