More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6143 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 
246 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 
245 aa  279  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
246 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
260 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
242 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  43.1 
 
 
245 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  43.51 
 
 
244 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
244 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
252 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
241 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
245 aa  168  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
257 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
236 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
231 aa  161  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
236 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
237 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
263 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
250 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
229 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
234 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
234 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
270 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
241 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
237 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
251 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.65 
 
 
257 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
233 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
237 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
247 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.15 
 
 
240 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
244 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
231 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
249 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
239 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
229 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
239 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
227 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
238 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
240 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  33.19 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
256 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  33.33 
 
 
245 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
243 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
244 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
244 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
236 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
236 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
239 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
266 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  33.95 
 
 
263 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
244 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  31.11 
 
 
243 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.63 
 
 
246 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
272 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 
273 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  32.34 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.12 
 
 
246 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.5 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02469  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01530)  31.94 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
284 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
233 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  30.5 
 
 
316 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  31.71 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  33.18 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
287 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
281 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
286 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>