280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6109 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 240 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  55 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  51.26 
 
 		 239 aa  276  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  53.56 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  53.14 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  53.14 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  53.14 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  53.14 
 
 		 239 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  52.72 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  52.74 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  51.27 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  51.48 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  51.48 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  51.05 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  45.11 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  39.48 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  39.48 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  39.53 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  35.47 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  36.97 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  30.96 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  38.12 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  32.07 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  33.95 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  34.31 
 
 		 234 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  38.69 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 		 244 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  35.96 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  34.45 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  34.25 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  36.22 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  30.25 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.97 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.21 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.68 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  34.74 
 
 		 236 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  32.87 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  34.74 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  34.74 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.38 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  32.49 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  34.27 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  30.13 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  36.69 
 
 		 184 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  28.15 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.37 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  36.14 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  30.48 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  38.42 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  36.32 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  32.99 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  36.56 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  33.01 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  34.91 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.72 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.89 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  34.72 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.92 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  28.95 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  35.05 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  32.14 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.5 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  33.49 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  34.03 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  30.81 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  39.22 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  31.84 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  32.58 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  31.98 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  30.98 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  28.03 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  32.6 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.77 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.45 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  27.63 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  36.94 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  34.01 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.06 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  30.51 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  28.57 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>