More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5964 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 134 aa  279  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  44.25 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  40.29 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  39.2 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 168 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5551  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  42.86 
 
 		 291 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 276 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 278 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  37.19 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 291 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  39.45 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 291 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  35.34 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.14 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.61 
 
 		 250 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 265 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 278 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.45 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  44.57 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 322 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 281 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 281 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 255 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  40.21 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  35.14 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0799  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 296 aa  74.7  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 303 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 275 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 277 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 311 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 274 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 250 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  35.78 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719173  decreased coverage  0.000000135353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  35.71 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 311 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>